More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1911 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 451 aa  909    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  54.33 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  52.89 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  51.83 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  50.57 
 
 		 444 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  53.01 
 
 		 463 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  50.92 
 
 		 444 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  49.77 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  49.77 
 
 		 444 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  46.91 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  50.35 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  49.1 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  39.64 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  40.77 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  39.42 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  41.71 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  39.25 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  39.86 
 
 		 453 aa  299  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  41.12 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  40.05 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  40.28 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  40.05 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  37.75 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  38.43 
 
 		 435 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  39.86 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  39.86 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  39.86 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  37.73 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  39.47 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  39.64 
 
 		 457 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  39.64 
 
 		 457 aa  286  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  39.64 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  38.04 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  39.2 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  39.15 
 
 		 432 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  40.52 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  36.77 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  37.95 
 
 		 453 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  40.14 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  38.31 
 
 		 456 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  36.85 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  39.15 
 
 		 453 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  39.78 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  38.07 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  36.99 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  35.62 
 
 		 442 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  35.71 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  39.01 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  39.25 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  38.65 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  37.42 
 
 		 453 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  37.05 
 
 		 443 aa  253  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  36.94 
 
 		 458 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  35.79 
 
 		 446 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  36.99 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  35.12 
 
 		 446 aa  249  9e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  35.12 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  34.89 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  37.69 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  36.76 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  38.8 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  35.11 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.76 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  38.39 
 
 		 449 aa  246  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  36.63 
 
 		 445 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  37.25 
 
 		 453 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  37.76 
 
 		 444 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  37.92 
 
 		 447 aa  247  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.83 
 
 		 445 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  36.32 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 442 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  35.08 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.88 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.46 
 
 		 445 aa  243  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  35.29 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  36.54 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  36.91 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.4 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  36.67 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  36.94 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  36.59 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  35.07 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  34.09 
 
 		 441 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  35.81 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  38.06 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  34.84 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  36.21 
 
 		 455 aa  239  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  34.84 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  34.84 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  34.84 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  38.02 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  34.84 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  38.02 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  34.84 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  37.28 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>