More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2273 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 444 aa  926    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  89.64 
 
 		 444 aa  847    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  87.61 
 
 		 444 aa  833    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  64.41 
 
 		 444 aa  628  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  67.79 
 
 		 444 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  63.64 
 
 		 464 aa  599  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  60.36 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  63.01 
 
 		 459 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  61.56 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  58.5 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  50 
 
 		 452 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  50.57 
 
 		 451 aa  428  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  42.44 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  42.89 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  41.53 
 
 		 451 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  42.34 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  41.36 
 
 		 452 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  41.12 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  41.67 
 
 		 457 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  41.67 
 
 		 457 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  40.41 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  39.32 
 
 		 451 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  39.32 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  39.32 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  38.85 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  40.67 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  40.14 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  41.5 
 
 		 436 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  41.5 
 
 		 436 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  41.5 
 
 		 436 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  39.34 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  39.69 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  38.65 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  38.19 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  38.97 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  39.03 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  38.36 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  39.73 
 
 		 435 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  38.64 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  38.36 
 
 		 436 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  37.96 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  37.62 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  36.79 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  39.2 
 
 		 432 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  37.24 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  37 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  36.22 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  38.58 
 
 		 445 aa  276  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  36.71 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  36.27 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  37.36 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  35.11 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  37.86 
 
 		 451 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.34 
 
 		 451 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  35.63 
 
 		 456 aa  265  8.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.64 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.98 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  38.46 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  35.63 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  37.3 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  34.97 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37.3 
 
 		 444 aa  262  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  37.42 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.91 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  36.1 
 
 		 444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  36.75 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  35.43 
 
 		 443 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.54 
 
 		 442 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  36.75 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  37.47 
 
 		 444 aa  256  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  35.7 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  36.77 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  35.75 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  36.34 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.44 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  35.19 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.87 
 
 		 445 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  34.98 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  35.49 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  35.11 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  35.11 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  35.43 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  33.85 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  35.7 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.99 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  34.08 
 
 		 445 aa  250  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  36.32 
 
 		 442 aa  249  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  34.88 
 
 		 446 aa  249  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  33.7 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  37.42 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  36.32 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  34.37 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  35.6 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  32.68 
 
 		 446 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  32.68 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  35.48 
 
 		 453 aa  246  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>