More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0456 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  100 
 
 
459 aa  957    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  66.02 
 
 
464 aa  658    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  69.86 
 
 
442 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  69.3 
 
 
463 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  62.9 
 
 
444 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  63.76 
 
 
444 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  63.49 
 
 
444 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  63.01 
 
 
444 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  62.98 
 
 
444 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  59.59 
 
 
446 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  52.89 
 
 
451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  51.04 
 
 
452 aa  448  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  42.28 
 
 
451 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  42.76 
 
 
453 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  42.86 
 
 
457 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  41.36 
 
 
461 aa  346  6e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  39.18 
 
 
452 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  41.33 
 
 
455 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  42.19 
 
 
457 aa  339  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  42.19 
 
 
457 aa  339  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  41.59 
 
 
435 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  40.55 
 
 
435 aa  333  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  41.61 
 
 
432 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  39.38 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  40.76 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  39.82 
 
 
453 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  41.71 
 
 
438 aa  324  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  40.76 
 
 
432 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  40.76 
 
 
432 aa  322  8e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  40.52 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  40.52 
 
 
432 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  40.6 
 
 
435 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  38.69 
 
 
435 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  40.98 
 
 
434 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  38.72 
 
 
435 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  42.09 
 
 
436 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  38.89 
 
 
451 aa  315  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  41.24 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  38.89 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  41.24 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  38.89 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  41.24 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  39.81 
 
 
461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  39.96 
 
 
480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  39.7 
 
 
456 aa  308  9e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  40.76 
 
 
432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  40.27 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  37.89 
 
 
446 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  37.67 
 
 
446 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  36.57 
 
 
433 aa  291  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  38.55 
 
 
446 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  38.44 
 
 
452 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  37.44 
 
 
446 aa  287  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  38.31 
 
 
448 aa  286  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  38.17 
 
 
445 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  37.16 
 
 
442 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  37.28 
 
 
456 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  36.7 
 
 
452 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  37.47 
 
 
443 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  36.07 
 
 
441 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  37.92 
 
 
452 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  36.32 
 
 
458 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.04 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  38.01 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  36.1 
 
 
443 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  38.22 
 
 
444 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  35.35 
 
 
442 aa  274  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  33.93 
 
 
445 aa  274  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  36.4 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  36.47 
 
 
448 aa  272  7e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  37.41 
 
 
451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  36.9 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37 
 
 
444 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  35.76 
 
 
453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  36.36 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 
444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  35.76 
 
 
453 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  35.7 
 
 
444 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.4 
 
 
443 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  36.2 
 
 
453 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  36.28 
 
 
453 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  36.97 
 
 
448 aa  263  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  36.15 
 
 
442 aa  264  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  36.45 
 
 
442 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  36.89 
 
 
453 aa  263  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  37.28 
 
 
441 aa  263  6e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  36.38 
 
 
444 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  36.12 
 
 
442 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  35.04 
 
 
443 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 
441 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  37.42 
 
 
449 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  35.25 
 
 
445 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 
444 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  36.51 
 
 
442 aa  260  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  37.31 
 
 
444 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  36.16 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  34.9 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>