More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5641 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  88.97 
 
 
435 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  85.06 
 
 
461 aa  793    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  72.89 
 
 
438 aa  673    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  95.4 
 
 
435 aa  876    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  100 
 
 
435 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  87.36 
 
 
435 aa  810    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  68.2 
 
 
432 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  67.74 
 
 
432 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  66.44 
 
 
453 aa  618  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  65.98 
 
 
432 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  66.21 
 
 
432 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  66.36 
 
 
432 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  66.21 
 
 
432 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  61.61 
 
 
435 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  58.37 
 
 
434 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  61.15 
 
 
436 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  40.59 
 
 
442 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  40.5 
 
 
464 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  39.4 
 
 
451 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  39.59 
 
 
453 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  40.87 
 
 
463 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  40.82 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  38.64 
 
 
444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  39.41 
 
 
446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  38.72 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  40.14 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  40.14 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  40.14 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  40.59 
 
 
435 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  39.28 
 
 
480 aa  299  7e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  38.17 
 
 
444 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  37.3 
 
 
444 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  38.93 
 
 
456 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  37.94 
 
 
444 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  39.63 
 
 
453 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  37.44 
 
 
452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  39.08 
 
 
457 aa  286  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  39.08 
 
 
457 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  39.21 
 
 
457 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  37.24 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  37.35 
 
 
461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  38.34 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  38.69 
 
 
451 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  38.69 
 
 
451 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  38.69 
 
 
451 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  36.77 
 
 
451 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  36.76 
 
 
456 aa  261  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  36 
 
 
452 aa  259  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  34.23 
 
 
458 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  33.04 
 
 
445 aa  244  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  33.03 
 
 
442 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  32.74 
 
 
443 aa  240  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 
433 aa  240  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 
444 aa  237  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
449 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 
444 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  32.52 
 
 
452 aa  232  8.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.44 
 
 
444 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  32.96 
 
 
448 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.29 
 
 
441 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.54 
 
 
440 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.6 
 
 
444 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.08 
 
 
451 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  31.7 
 
 
445 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  33.03 
 
 
447 aa  228  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  34.08 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 
448 aa  226  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  32.58 
 
 
444 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  32.81 
 
 
442 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.89 
 
 
443 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  32.28 
 
 
442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  32.51 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  31.82 
 
 
453 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  31.82 
 
 
453 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 
442 aa  222  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.06 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.98 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  34.38 
 
 
456 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.08 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.72 
 
 
443 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  32.16 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  31.59 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.63 
 
 
439 aa  219  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 
444 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 
444 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 
444 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 
444 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  31.94 
 
 
444 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 
444 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 
444 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1850  glutamate--ammonia ligase  31.54 
 
 
461 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057592  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.3 
 
 
450 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  31.7 
 
 
446 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  31.7 
 
 
446 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  32.24 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  31.5 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  32.72 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>