More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2296 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 434 aa  894    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  69.68 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  63.81 
 
 		 432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  63.89 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  63.34 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  62.04 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  62.41 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  61.63 
 
 		 453 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  62.96 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  63.81 
 
 		 432 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  60.47 
 
 		 435 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  59.3 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  58.37 
 
 		 435 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  58 
 
 		 435 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  57.77 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  57.7 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  40.82 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  44.1 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  40.6 
 
 		 444 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  42.82 
 
 		 435 aa  325  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  41.01 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  41.98 
 
 		 444 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  42.17 
 
 		 464 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  38.34 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  39.95 
 
 		 453 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  43.82 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  39.77 
 
 		 461 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  42.66 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  41.08 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  39.95 
 
 		 455 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  43.12 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  43.12 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  43.12 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  38.94 
 
 		 457 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  41.94 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  38.62 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  38.62 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  40.98 
 
 		 459 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  39.67 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  40.05 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  38.43 
 
 		 452 aa  293  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  37.96 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  37.32 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  37.36 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  37.13 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  37.13 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  36.24 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  35.52 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  36.53 
 
 		 444 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  36.3 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  36.49 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  35.23 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 		 443 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  35.55 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  36.07 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  33.63 
 
 		 447 aa  236  8e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 		 445 aa  236  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.03 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  36.07 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.85 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.63 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  34.91 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  32.8 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  32.8 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.17 
 
 		 447 aa  230  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.63 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  35.37 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  33.63 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  32.57 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.57 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  35.15 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  35.59 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.21 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  35.63 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  34.26 
 
 		 437 aa  226  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  33.49 
 
 		 443 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.09 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  35.01 
 
 		 453 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.07 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.09 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  32.59 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  34.92 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  36.01 
 
 		 452 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.41 
 
 		 444 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  35.45 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  35.01 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  33.41 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  34.69 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  34.71 
 
 		 453 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  35.32 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>