More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5509 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  89.43 
 
 		 435 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  82.11 
 
 		 436 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  82.11 
 
 		 436 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 435 aa  890    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  82.11 
 
 		 436 aa  716    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  76.47 
 
 		 456 aa  668    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  61.17 
 
 		 480 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  42.25 
 
 		 464 aa  349  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  43.61 
 
 		 453 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  44.34 
 
 		 432 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  44.04 
 
 		 463 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  43.31 
 
 		 432 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  42.17 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  42.99 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  41.28 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  40.09 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  41.95 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  43.76 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  41.5 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  43.31 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  39.96 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  40.91 
 
 		 451 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  39.42 
 
 		 444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  41.51 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  39.73 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  42.03 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  41.37 
 
 		 457 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  43.08 
 
 		 432 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  39.6 
 
 		 442 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  40.83 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  38.6 
 
 		 444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  41.27 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  40.27 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  43.99 
 
 		 432 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  41.16 
 
 		 461 aa  312  9e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  42.34 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  38.62 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  41.5 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  41.5 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  41.67 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  39.05 
 
 		 453 aa  295  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  38.7 
 
 		 452 aa  286  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  36.67 
 
 		 451 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  36.67 
 
 		 451 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  36.44 
 
 		 451 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  36.94 
 
 		 451 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  35.16 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.22 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  34.38 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  35.02 
 
 		 458 aa  226  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  33.48 
 
 		 448 aa  219  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  35.53 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.7 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.86 
 
 		 444 aa  212  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  31.79 
 
 		 445 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  34.66 
 
 		 444 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 		 453 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  32.3 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 447 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  32.75 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  34.64 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  34.5 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  32.16 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  34.68 
 
 		 450 aa  206  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  35.11 
 
 		 445 aa  206  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  33.26 
 
 		 445 aa  206  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.16 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  31.26 
 
 		 457 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  33.78 
 
 		 442 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 443 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  31.65 
 
 		 448 aa  202  9e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.09 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  35.08 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  31.87 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  33.19 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.51 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  34.97 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  34.15 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  33.78 
 
 		 446 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  34.21 
 
 		 449 aa  199  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  32.97 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  33.19 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  33.12 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  34.08 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>