More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4021 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  79.28 
 
 		 453 aa  751    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 457 aa  948    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  70.95 
 
 		 451 aa  698    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  75.67 
 
 		 455 aa  711    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  77.23 
 
 		 453 aa  724    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 457 aa  948    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  69.59 
 
 		 461 aa  653    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  96.06 
 
 		 457 aa  894    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  49.78 
 
 		 452 aa  461  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  51.34 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  51.34 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  51.12 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  42.14 
 
 		 464 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  44.52 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  42.79 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  44.2 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  41.67 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  41.67 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  43.41 
 
 		 444 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  41.38 
 
 		 444 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  42.27 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  41.42 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  43.57 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  43.57 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  43.34 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  42.19 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  41.72 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  38.62 
 
 		 434 aa  319  7e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  42.05 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  42.28 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  42.05 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  42.05 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  40.05 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  41.07 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  39.68 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  41.5 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  39.12 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  39.44 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  38.67 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  39.72 
 
 		 461 aa  302  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  38.6 
 
 		 435 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  39.08 
 
 		 435 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  40.14 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  38.62 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  40.04 
 
 		 480 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  39.64 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  40.83 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  39.21 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  39.68 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  38.39 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  39.31 
 
 		 452 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  36.08 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  36.12 
 
 		 444 aa  259  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.02 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  34.78 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  34.87 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.1 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.36 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  35.73 
 
 		 441 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.96 
 
 		 445 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 		 445 aa  249  6e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  35.11 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  34.21 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  33.62 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.1 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 443 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.14 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.89 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.84 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.84 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  34.07 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  36.48 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  33.9 
 
 		 447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.28 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.13 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  33.55 
 
 		 447 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  32.75 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  32.41 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  32.97 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  32.97 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  32.53 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  31.44 
 
 		 447 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  34 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.52 
 
 		 443 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.07 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  32.16 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 441 aa  230  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  32.91 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  32.37 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>