More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1347 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  65.09 
 
 		 444 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 444 aa  932    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  67.57 
 
 		 444 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  65.99 
 
 		 444 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  64.41 
 
 		 444 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  62.16 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  61.17 
 
 		 464 aa  591  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  62.9 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  60.27 
 
 		 463 aa  564  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  58.65 
 
 		 446 aa  552  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  48.49 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  46.91 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  41.39 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  40.94 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  42.28 
 
 		 455 aa  349  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  41.59 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  40.32 
 
 		 452 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  40.47 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  42.55 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  41.59 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  40.6 
 
 		 434 aa  335  9e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  42.49 
 
 		 432 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  41.13 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  41.84 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  41.59 
 
 		 438 aa  332  6e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  41.38 
 
 		 457 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  41.38 
 
 		 457 aa  332  8e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  39.55 
 
 		 453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  40.66 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  40.5 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  42.08 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  41.41 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  39.43 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  39.5 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  38.67 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  40.05 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  38.26 
 
 		 451 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  39.68 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  38.26 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  38.26 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  38.64 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  38.43 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  40 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  40 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  40 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  39.96 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  38.72 
 
 		 456 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  38.08 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  37.83 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  36.12 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  35.08 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  35.98 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.14 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  36.22 
 
 		 444 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  35.65 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  35.53 
 
 		 445 aa  272  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  35.75 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.44 
 
 		 442 aa  269  7e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.4 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  36.4 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.58 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  36.59 
 
 		 443 aa  266  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  35.94 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  36.81 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  36.23 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.45 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  35.71 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  35.94 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  37.05 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  34.81 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  34.15 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 449 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  34.88 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  35.63 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 		 451 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  34.14 
 
 		 448 aa  259  9e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.99 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  34.47 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.58 
 
 		 448 aa  256  6e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  33.12 
 
 		 446 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  34.13 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  36.18 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  37.61 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  34.14 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.68 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  36.95 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  34.77 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  34.95 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  32.9 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  36.64 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  35.94 
 
 		 445 aa  252  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  34.21 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 446 aa  250  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  35.1 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  33.92 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>