More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0794 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  72.73 
 
 		 453 aa  729    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  70.09 
 
 		 457 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  75.39 
 
 		 451 aa  737    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  72.35 
 
 		 453 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  69.35 
 
 		 457 aa  656    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  81.72 
 
 		 455 aa  784    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 461 aa  961    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  69.35 
 
 		 457 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  52.21 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  51.76 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  51.54 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  51.76 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  42.63 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  42.7 
 
 		 444 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  42.92 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  42.7 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  41.7 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  43.05 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  42.92 
 
 		 458 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  40.85 
 
 		 444 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  42.5 
 
 		 442 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  41.36 
 
 		 459 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  40.27 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  43.06 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  39.77 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  40.89 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  40.89 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  40.67 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  40.53 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  39.68 
 
 		 432 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  40.67 
 
 		 451 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  39.05 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  39.45 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  39.36 
 
 		 432 aa  309  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  39.3 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  39.68 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  39.82 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  39.82 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  39.82 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  41.16 
 
 		 435 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  39.45 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  39.91 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  38.05 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  40.23 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  38.07 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  37.35 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  38.02 
 
 		 461 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  37.35 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  37.21 
 
 		 456 aa  293  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  36.89 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  38.16 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37.19 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  34.57 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  36.65 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  35.98 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  35.68 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  35.56 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  36.17 
 
 		 448 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  35.67 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.15 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.13 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.55 
 
 		 444 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.53 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  35.04 
 
 		 440 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.98 
 
 		 450 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  34.24 
 
 		 456 aa  245  9e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  34.85 
 
 		 439 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  35.57 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  34.43 
 
 		 444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  35.06 
 
 		 443 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.2 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  34.85 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.67 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  34.57 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  37.39 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  35.38 
 
 		 447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.66 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  34.08 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.44 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  34.21 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 		 446 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  35.46 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.69 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.05 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.94 
 
 		 451 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  35.57 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  34.12 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  35.14 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  33.76 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  34.87 
 
 		 451 aa  233  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  35.11 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  34.57 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  32.22 
 
 		 445 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  34 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  34 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>