More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3525 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  100 
 
 
480 aa  983    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  62.23 
 
 
456 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  64.27 
 
 
435 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  61.94 
 
 
436 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  61.94 
 
 
436 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  61.94 
 
 
436 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  62.08 
 
 
435 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  44.1 
 
 
434 aa  346  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  41.86 
 
 
463 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  40.76 
 
 
464 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  43.21 
 
 
453 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  43.21 
 
 
432 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  42.83 
 
 
432 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  42.08 
 
 
446 aa  333  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  41.83 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  40.13 
 
 
453 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  42.4 
 
 
435 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  39.87 
 
 
444 aa  322  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  41.39 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  40.95 
 
 
442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  40.27 
 
 
444 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  40.89 
 
 
461 aa  319  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  41.83 
 
 
432 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  39.1 
 
 
444 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  39.46 
 
 
444 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  39.61 
 
 
444 aa  312  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  39.95 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  39.74 
 
 
432 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  40.18 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  39.82 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  42.32 
 
 
436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  38.58 
 
 
451 aa  307  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  39.28 
 
 
435 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  40.99 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  40.17 
 
 
459 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  40.23 
 
 
461 aa  299  7e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  39.74 
 
 
452 aa  299  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  38.62 
 
 
455 aa  299  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  40.67 
 
 
457 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  40.67 
 
 
457 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  38.21 
 
 
453 aa  292  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  38.96 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  36.4 
 
 
452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  37.61 
 
 
451 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  37.61 
 
 
451 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  37.61 
 
 
451 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  36.98 
 
 
451 aa  246  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  34.08 
 
 
453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  34.08 
 
 
453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  34.08 
 
 
453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  35.62 
 
 
458 aa  229  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  33.76 
 
 
456 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
441 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  33.55 
 
 
442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.44 
 
 
444 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.6 
 
 
444 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  35.32 
 
 
443 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.19 
 
 
440 aa  210  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 
451 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  33.4 
 
 
433 aa  206  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  32.83 
 
 
443 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  32.03 
 
 
442 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  29.41 
 
 
445 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  31.57 
 
 
448 aa  204  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  31.66 
 
 
445 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.3 
 
 
445 aa  203  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  35.95 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  31.89 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  33.04 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  34.5 
 
 
444 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  31.66 
 
 
446 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  32.39 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  34.13 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  30.87 
 
 
447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.07 
 
 
450 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.78 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  33.04 
 
 
447 aa  196  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 
449 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  33.83 
 
 
450 aa  196  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 
432 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  31.66 
 
 
446 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  32.68 
 
 
453 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  30.91 
 
 
442 aa  194  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 
446 aa  194  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.1 
 
 
444 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  32.62 
 
 
448 aa  193  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  31.74 
 
 
445 aa  193  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  32.97 
 
 
444 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  30.44 
 
 
457 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  31.37 
 
 
444 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  33.84 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  32.02 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  31.47 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  32.16 
 
 
453 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 
444 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  32.46 
 
 
444 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  30.57 
 
 
443 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  30.67 
 
 
443 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>