More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2810 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 432 aa  904    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 		 457 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  54.4 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  49.08 
 
 		 443 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  48.98 
 
 		 449 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  51.72 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2030  glutamate--ammonia ligase  52.73 
 
 		 445 aa  438  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  48.74 
 
 		 442 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  48.64 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  47.72 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  47.61 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  47.18 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  47.86 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  46.74 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  48.2 
 
 		 444 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  48.2 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  45.45 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  47.64 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  44.32 
 
 		 442 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  42.08 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  43.64 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  43.69 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  43.47 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  45.45 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  43.25 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  42.79 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  43.02 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  46.4 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  42.79 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  44.52 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  40.67 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  42.34 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  42.34 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  42.34 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  42.34 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  42.34 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  42.57 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  42.34 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  42.34 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  43.97 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  41.61 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  43.95 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  43.21 
 
 		 456 aa  364  1e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  44.09 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  40.91 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  41.5 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  43.22 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  41.46 
 
 		 447 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  41.27 
 
 		 446 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  41.27 
 
 		 446 aa  355  8.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  41.59 
 
 		 456 aa  355  8.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  41.08 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  43.44 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  39.19 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  43.99 
 
 		 451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  41.86 
 
 		 461 aa  351  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  43.65 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  43.99 
 
 		 451 aa  350  4e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  40.23 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  41.3 
 
 		 448 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  40.54 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  41.08 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  40.13 
 
 		 446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  39.77 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  41.24 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  39.64 
 
 		 446 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  39.1 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  38.5 
 
 		 448 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  40.81 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  39.22 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  40.59 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  38.95 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  39.91 
 
 		 450 aa  318  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  38.55 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  38.44 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  37.3 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  39.5 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  37.14 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  39.37 
 
 		 452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  40.54 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  38.2 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  39.54 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  38.21 
 
 		 439 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  37.67 
 
 		 446 aa  312  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  38.96 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  37.59 
 
 		 443 aa  309  5e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  37.36 
 
 		 443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  36.9 
 
 		 443 aa  308  9e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  39.05 
 
 		 453 aa  308  9e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  37.47 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  38.37 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  41.78 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  36.38 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  38.27 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  39.54 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  37.53 
 
 		 439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  37.81 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  37.78 
 
 		 452 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  37.11 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  37.47 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>