More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2370 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 452 aa  931    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  53.45 
 
 		 451 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  50.34 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  50.8 
 
 		 444 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  52.14 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  50.34 
 
 		 444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  49.89 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  50.9 
 
 		 459 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  50.35 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  48.08 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  49.1 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  45.17 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  39.82 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  38.08 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  39 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  35.84 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  39.24 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  37.5 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  38.93 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  38.93 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  36.81 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  36.81 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  36.81 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  36 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  36.7 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  37.28 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  37.88 
 
 		 432 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37.8 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  36 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  35.87 
 
 		 435 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  37.64 
 
 		 432 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  36.94 
 
 		 445 aa  262  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  36.08 
 
 		 432 aa  261  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  37 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  37.64 
 
 		 432 aa  260  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  36.24 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  35.73 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  38.16 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  35.9 
 
 		 435 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  35.19 
 
 		 453 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.64 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  37.41 
 
 		 438 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  36.51 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  36.12 
 
 		 456 aa  256  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  35.17 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  37.64 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  35.94 
 
 		 480 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  36.32 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  36.51 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  34.5 
 
 		 446 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  36.67 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  34.88 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.82 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  36.74 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  38.16 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  34.92 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  34.43 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.89 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  35.82 
 
 		 448 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  34.52 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  36.77 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  36.89 
 
 		 451 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  34.65 
 
 		 446 aa  245  9e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  36.6 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  34.23 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  35.76 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  36.3 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  36.32 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  36 
 
 		 449 aa  239  5e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  35.32 
 
 		 440 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  35.43 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  32.52 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  35.54 
 
 		 452 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  34.33 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  35.2 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  36.1 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.62 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  37.24 
 
 		 450 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.66 
 
 		 450 aa  236  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  33.04 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  34.98 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  33.19 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  35.23 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  34.24 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  33.64 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  33.49 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  34.02 
 
 		 439 aa  229  9e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>