More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2247 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  68.69 
 
 		 444 aa  639    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  87.61 
 
 		 444 aa  833    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  65.09 
 
 		 444 aa  638    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  90.54 
 
 		 444 aa  856    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 444 aa  927    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  64.09 
 
 		 464 aa  601  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  61.94 
 
 		 442 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  65.15 
 
 		 463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  63.49 
 
 		 459 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  59.64 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  51.52 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  51.83 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  43.72 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  42.89 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  43.12 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  41.81 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  42.7 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  42.79 
 
 		 457 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  41.78 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  41.67 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  41.67 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  42.02 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  40 
 
 		 451 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  40 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  40 
 
 		 451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  39.32 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  40.67 
 
 		 435 aa  325  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  41.31 
 
 		 432 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  40.85 
 
 		 432 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  41.08 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  40.61 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  39.67 
 
 		 432 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  39.82 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  39.67 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  39.82 
 
 		 456 aa  305  8.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  39.67 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  41.08 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  39.29 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  40.55 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  40.55 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  40.55 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  39.42 
 
 		 435 aa  298  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  40.89 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  38.17 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  38.23 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  38.46 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  38.17 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  37.56 
 
 		 458 aa  289  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  38.7 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  35.78 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  38.05 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  37.75 
 
 		 450 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  38.43 
 
 		 444 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  37.84 
 
 		 451 aa  279  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  36.96 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  37.58 
 
 		 452 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  38.75 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  39.11 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.83 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  39.51 
 
 		 452 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  37.25 
 
 		 461 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  35.25 
 
 		 449 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  36.34 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  37.87 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  35.48 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  38.48 
 
 		 449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  36.18 
 
 		 445 aa  269  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  36.22 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  36.88 
 
 		 442 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  38.62 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  36.96 
 
 		 442 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  36.95 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  36.1 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  35.41 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  35.56 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  36.09 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  37.53 
 
 		 443 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  38.31 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  34.99 
 
 		 442 aa  262  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  37.53 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  36.16 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  36.22 
 
 		 446 aa  261  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  35.59 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  37.78 
 
 		 443 aa  261  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  37.92 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.4 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  37.19 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  33.92 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  38.08 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 442 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  34.95 
 
 		 440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.39 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  36.3 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  34 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  36.08 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  36.08 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  36.42 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  36.08 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>