More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6502 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 496 aa  978    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  62.52 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  57.59 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  46.57 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  40.09 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  39.87 
 
 		 450 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  39.87 
 
 		 450 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  37.77 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  38.74 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  38.74 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  39 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  37.94 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  38.53 
 
 		 437 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  35.9 
 
 		 451 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  35.49 
 
 		 448 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  37.18 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  39.96 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  35.34 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  35.6 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  34.91 
 
 		 443 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  33.33 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  27.85 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  31.3 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  27.45 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  30.39 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  28.82 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  29.18 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  28.33 
 
 		 449 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  32.99 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  28.14 
 
 		 456 aa  158  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  27.06 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  27.39 
 
 		 451 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  32.08 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  32.54 
 
 		 451 aa  153  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  26.58 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  28.33 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  27.81 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  28.66 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  27.39 
 
 		 450 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  29.28 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  31.21 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  31.91 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  28.78 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  28.17 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  29.41 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  29.34 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  27.41 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28.17 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  29.02 
 
 		 452 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  26.26 
 
 		 445 aa  147  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  28.95 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  27.1 
 
 		 444 aa  146  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  27.73 
 
 		 444 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  26.54 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  27.9 
 
 		 432 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  28.96 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  27.31 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  28.1 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  26.02 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  25.44 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  26.32 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  27.83 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  28.53 
 
 		 443 aa  143  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  27.71 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  29.64 
 
 		 443 aa  143  9e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  25.43 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  29.4 
 
 		 459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  27.87 
 
 		 865 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  26.39 
 
 		 445 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  28.81 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  29.21 
 
 		 442 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 		 445 aa  140  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  28.87 
 
 		 453 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  28.63 
 
 		 444 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  26.94 
 
 		 437 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  27.17 
 
 		 443 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  26.92 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  28.13 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  24.95 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  28.84 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  28.18 
 
 		 445 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  29.15 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  27.1 
 
 		 432 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  29.94 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  27.54 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  25.11 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  28.18 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  28.66 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  28.94 
 
 		 451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  25.77 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  24.32 
 
 		 440 aa  136  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  28.09 
 
 		 445 aa  136  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  26.78 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  26.96 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 452 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.3 
 
 		 439 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  30.11 
 
 		 444 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  28.01 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>