More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0223 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  99.08 
 
 		 437 aa  856    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 437 aa  863    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  99.08 
 
 		 437 aa  856    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  76.8 
 
 		 442 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  54.52 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  48.4 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  47.83 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  47.72 
 
 		 450 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  47.83 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  47.69 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  41.61 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  38.32 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  40.17 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  33.68 
 
 		 525 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  35.13 
 
 		 443 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  34.98 
 
 		 443 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  33.1 
 
 		 443 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  29.93 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  29.25 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  33.49 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  32.57 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  31.64 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  28.01 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  31.03 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  32.66 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  30.61 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  28.17 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  29.07 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  29.13 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  32.34 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  26.6 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  29.71 
 
 		 431 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  31.93 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  29.88 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  27.4 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  30.72 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  30.55 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  29.6 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  29.97 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  31.42 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  27.38 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  30.33 
 
 		 445 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  29.38 
 
 		 446 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  27.57 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  27.08 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  28.18 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  31.15 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  31.52 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  29.15 
 
 		 445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  28.12 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  31.17 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  31.45 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  30.16 
 
 		 456 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  29.15 
 
 		 444 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  28.39 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  30.9 
 
 		 451 aa  126  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  27.59 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  30.06 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  25.81 
 
 		 865 aa  126  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  29.39 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  28.18 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  27.95 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  30.9 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  29.06 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  28.09 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  29.12 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  29.86 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  30.67 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  30.03 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  29.86 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  27.67 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  26.92 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  30.37 
 
 		 457 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  33.58 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  29.6 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  30.09 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  25.75 
 
 		 450 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3720  glutamate--ammonia ligase  30.21 
 
 		 429 aa  123  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698416  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  26.27 
 
 		 446 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  27.47 
 
 		 464 aa  123  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  30.94 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  29.01 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  29.2 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  29.97 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2918  glutamine synthetase protein  31.38 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  30.36 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  29.03 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  28.7 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  29.31 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  29.13 
 
 		 449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  29.8 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  29.09 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  29.57 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  27.25 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  28.28 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  29.95 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  26.02 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  26.83 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  28.51 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>