More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7851 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 439 aa  870    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  46.5 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  45.98 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  44.37 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  40.05 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  41.74 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  37.95 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  33.57 
 
 		 448 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  32.65 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  35.24 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  35.47 
 
 		 441 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  34.29 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  32.54 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  32.93 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  32.46 
 
 		 453 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  31.87 
 
 		 445 aa  162  9e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  32.14 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.87 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  30.4 
 
 		 453 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  35.75 
 
 		 447 aa  159  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  31.22 
 
 		 453 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  31.89 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  31.55 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  32.78 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  31.65 
 
 		 446 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  31.14 
 
 		 444 aa  155  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  32.45 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  28.57 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  30.46 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  30.71 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.31 
 
 		 443 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  30.34 
 
 		 445 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  31.74 
 
 		 445 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  31.05 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  31.41 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  31.67 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  33.26 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  31.39 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  33.26 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  30.34 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  30.81 
 
 		 449 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  33.49 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  31.9 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0246  Glutamate--ammonia ligase  29.57 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  32.38 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  30.84 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.43 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  30.43 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.75 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  29.79 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  27.99 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  29.88 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  30.17 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  30.07 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  31.25 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.95 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.98 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  33.64 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  30.59 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  28.24 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.51 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  28.78 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  31.16 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  28.83 
 
 		 445 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  29.27 
 
 		 446 aa  143  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  30.79 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  30.12 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  30.36 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  30.24 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.89 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  30.07 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 		 446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  30.92 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  31.87 
 
 		 496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  30.28 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  29.12 
 
 		 442 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  31.14 
 
 		 433 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  29.88 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  31.43 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  29.29 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  29.3 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  32.63 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.49 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  29.57 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  29.05 
 
 		 452 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  29.51 
 
 		 443 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  29.23 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  34.46 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  32.48 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  27.75 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28.53 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  28.3 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  28.27 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>