More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3286 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  888    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  55.66 
 
 
448 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  54.09 
 
 
451 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  46.4 
 
 
469 aa  348  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  34.68 
 
 
445 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  34.09 
 
 
449 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  36.57 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  36.79 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  35.46 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.19 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.19 
 
 
433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
453 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.25 
 
 
444 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  33.93 
 
 
455 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.49 
 
 
442 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  35.6 
 
 
496 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  34.23 
 
 
444 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  32.82 
 
 
451 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.63 
 
 
444 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  31.22 
 
 
442 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  36.53 
 
 
444 aa  207  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  32.66 
 
 
451 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  33.19 
 
 
447 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  36.53 
 
 
451 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  29.82 
 
 
442 aa  206  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  29.47 
 
 
441 aa  206  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  30.21 
 
 
440 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.21 
 
 
445 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.02 
 
 
452 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  30.29 
 
 
456 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.49 
 
 
445 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  32.66 
 
 
447 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  30.18 
 
 
443 aa  203  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  30.39 
 
 
447 aa  202  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  33.18 
 
 
432 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.58 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  35.83 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  30.65 
 
 
453 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.18 
 
 
443 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  29.29 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  32.73 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  32.34 
 
 
456 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  31.07 
 
 
464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  32.05 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  32.05 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  32.05 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  31.51 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  32.88 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  31.8 
 
 
445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  34.1 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  34.18 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  31.37 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  32.3 
 
 
453 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  31.52 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  31.09 
 
 
449 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  29.63 
 
 
439 aa  196  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  32.1 
 
 
444 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 
445 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  35.93 
 
 
439 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 
446 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 
446 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  30.31 
 
 
444 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  32.05 
 
 
448 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 
445 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  30.37 
 
 
443 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  29.02 
 
 
440 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  31.67 
 
 
446 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  32.27 
 
 
442 aa  193  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  31.41 
 
 
446 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.36 
 
 
444 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  31.36 
 
 
446 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.13 
 
 
444 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  31.37 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  31.18 
 
 
450 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  28.78 
 
 
439 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  26.77 
 
 
445 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  32.72 
 
 
446 aa  189  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  31.3 
 
 
444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.5 
 
 
443 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  31.3 
 
 
444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  31.57 
 
 
446 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.34 
 
 
443 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  31.84 
 
 
444 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  30.63 
 
 
448 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  30.8 
 
 
442 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  31.54 
 
 
448 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  30.23 
 
 
445 aa  187  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  33.68 
 
 
525 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  29.05 
 
 
446 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  34.18 
 
 
438 aa  186  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>