More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0242 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 447 aa  913    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  49.1 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 		 444 aa  435  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  48.76 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  48 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  48.76 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  48.53 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  49.22 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  47.98 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  47.76 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  48.65 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  48.74 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  49.77 
 
 		 443 aa  418  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  48.06 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  48.12 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  47.98 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  48.87 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  49.44 
 
 		 444 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  47.46 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  48.42 
 
 		 445 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  47.26 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  48.41 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  47.62 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  47.45 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  48.55 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  48.98 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  47.89 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  47.53 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  48.01 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  48.44 
 
 		 452 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  47.57 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  47.32 
 
 		 447 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  47.66 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  48.2 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  47.3 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  46.86 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  46.86 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  46.86 
 
 		 446 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  47.39 
 
 		 446 aa  395  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  44.8 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  46.53 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  46.52 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  46.85 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  47.02 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  45.86 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  47.29 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  46.99 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  47.97 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  44.14 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  45.8 
 
 		 445 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  46.09 
 
 		 446 aa  385  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  43.02 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  45.93 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  45.9 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  43.92 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  45.35 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  43.76 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  44.37 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  44.57 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  44.83 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  44.8 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  46.26 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  42.43 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  43.26 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  42.89 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  42.95 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  43.67 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  43.71 
 
 		 433 aa  363  4e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  45.41 
 
 		 452 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  44.57 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  43.54 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  45.23 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  45.41 
 
 		 445 aa  361  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  43.15 
 
 		 449 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  43.28 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  43.51 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  44.72 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  44.42 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  41.97 
 
 		 442 aa  358  8e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  44.22 
 
 		 444 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  43.29 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  44.57 
 
 		 446 aa  353  2e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  42.63 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  43.31 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  43.31 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  43.31 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  43.31 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  43.31 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  43.79 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08250  L-glutamine synthetase  44.47 
 
 		 445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.235557  normal  0.967917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  46.91 
 
 		 442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  43.31 
 
 		 444 aa  352  7e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  43.08 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  44.06 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  43.31 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  41.78 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  43.28 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  40.58 
 
 		 446 aa  349  5e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  41.2 
 
 		 447 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>