More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0173 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 452 aa  879    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  54.3 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  54.3 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  54.75 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  53.81 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  48.51 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  51.28 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  49.43 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  49.43 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  49.43 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  39.96 
 
 		 496 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  41.92 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  35.82 
 
 		 525 aa  206  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  34.5 
 
 		 469 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  38.81 
 
 		 442 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  33.55 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  32.24 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  32.33 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  31.46 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  30.86 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  29.58 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  33.1 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  34.7 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  29.53 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  35.21 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28.11 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  32.86 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  29.95 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  27.06 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30.2 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  30.31 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  31.32 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  27.99 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  28.17 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  29.91 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  29.09 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  27.19 
 
 		 447 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  30.04 
 
 		 446 aa  150  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  29 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  27.63 
 
 		 443 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  26.76 
 
 		 865 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  28.05 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  29.3 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  29.4 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  27.19 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  28.67 
 
 		 443 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  32.61 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  32.2 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  28.49 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  30.38 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  34.38 
 
 		 453 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  30.07 
 
 		 446 aa  146  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  30.67 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  29.3 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  30.09 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  28.41 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  29.32 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  32.49 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  30.55 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  31.52 
 
 		 444 aa  144  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  27.88 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  26.12 
 
 		 442 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  31.34 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  28.22 
 
 		 443 aa  143  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  32.46 
 
 		 446 aa  143  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  28.97 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  29.71 
 
 		 442 aa  142  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  28.41 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  27.69 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  26.65 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  29.52 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  28.92 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  29.84 
 
 		 446 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  29.71 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  29.86 
 
 		 448 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  28.07 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  28.07 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  29.02 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  29.18 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  31.11 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  29.38 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  28.8 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.57 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  31.44 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  29.43 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  30.12 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  29.33 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  28.61 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  28.6 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  28.08 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  32.47 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  27.36 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  30.08 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  28.07 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  29.14 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  30.25 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>