More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0315 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 525 aa  1028    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  62.92 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  50.98 
 
 		 442 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  45.13 
 
 		 455 aa  345  8e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  34.49 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  35.95 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  34.14 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  36.31 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  36.31 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  36.31 
 
 		 450 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  34.86 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  31.18 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  34.01 
 
 		 437 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  34.01 
 
 		 437 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  34.01 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  31.38 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  35.87 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  33.61 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  33.54 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  33.13 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  32.09 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  31.74 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  30.2 
 
 		 448 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  33.54 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  27.52 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28 
 
 		 448 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  29.15 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  27.18 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  26.99 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  28.14 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  28.21 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  26.06 
 
 		 456 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  28.3 
 
 		 444 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  28.51 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  26.57 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  27.74 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  28.64 
 
 		 456 aa  143  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  27.71 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  26.73 
 
 		 433 aa  143  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  28.96 
 
 		 437 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  26.26 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  29.34 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  27.45 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  28.54 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  26.93 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 444 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  26.88 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  28.72 
 
 		 448 aa  141  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  27.35 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  27.03 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  29.02 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  28.98 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  28.98 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  29.09 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 444 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  26.68 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  24.9 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  28.84 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  27.95 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  24.9 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  25.6 
 
 		 450 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  25.98 
 
 		 449 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  25 
 
 		 441 aa  136  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  28.57 
 
 		 435 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  26.01 
 
 		 446 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  25.71 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  25.79 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  26.46 
 
 		 444 aa  134  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  28.71 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  31.43 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  29.11 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  27.14 
 
 		 446 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  27.03 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  28.04 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  25.78 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  27.53 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  26.18 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  25.41 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  28.51 
 
 		 444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  26.43 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  25.15 
 
 		 497 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  26.46 
 
 		 444 aa  130  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  27.39 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  27.86 
 
 		 441 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  24.49 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.58 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  27.35 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  26.8 
 
 		 452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  28.24 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  27.23 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  27.03 
 
 		 443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  25.58 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  26.97 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  27.11 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  26.07 
 
 		 446 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>