More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0830 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 497 aa  1022    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  47.05 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  46.03 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  47.29 
 
 		 500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  46.11 
 
 		 486 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  46.14 
 
 		 478 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  43 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  41.97 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  40.25 
 
 		 456 aa  345  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  38.37 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  38.31 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  30.99 
 
 		 468 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  33.4 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  33.81 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  33.81 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  31.4 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  30.43 
 
 		 476 aa  203  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  30.43 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0800  glutamine synthetase  30.72 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  31.21 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  32.13 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.85 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  30.67 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  29.61 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  30.69 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  30.3 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  29.12 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  30.43 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  30.23 
 
 		 475 aa  190  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  30.32 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  29.01 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.18 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  31.74 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  32.03 
 
 		 458 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.9 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  32.52 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  31.82 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  28.95 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  28.6 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  31.52 
 
 		 458 aa  183  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  28.89 
 
 		 446 aa  183  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  32.55 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28.48 
 
 		 448 aa  183  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  30.23 
 
 		 449 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.87 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  28.63 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.74 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  31.24 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  31.24 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  32.48 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  31.24 
 
 		 460 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.59 
 
 		 456 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  30.44 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  29.12 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  31.59 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  34.31 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  29.12 
 
 		 452 aa  179  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  28.6 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  30.38 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  31.31 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  31.39 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  31.08 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  30.47 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  29.44 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  31.52 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  31.52 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  31.52 
 
 		 458 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.84 
 
 		 443 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 		 457 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  28.22 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  30.52 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  29.64 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  27.49 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  28.81 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  29.84 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  28.4 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  31.04 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  30.3 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  31 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  29.53 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  28.02 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  29.55 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  29.29 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  29.6 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  29.45 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  28.63 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  29.6 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  31.29 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  28.28 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  29.6 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  30.53 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  30.07 
 
 		 452 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  29.95 
 
 		 456 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  30.67 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  29.68 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  31.83 
 
 		 466 aa  173  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  30.22 
 
 		 452 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  29.01 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  28.91 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>