More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1446 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  100 
 
 
456 aa  929    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  44.54 
 
 
486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  43.97 
 
 
476 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  44.9 
 
 
478 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  43.01 
 
 
478 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  43.58 
 
 
479 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  39.91 
 
 
479 aa  363  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  40.25 
 
 
497 aa  345  8e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  39.1 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  37.18 
 
 
500 aa  309  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  33.76 
 
 
449 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  32.84 
 
 
444 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.91 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  32.77 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  31.78 
 
 
439 aa  219  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  34.56 
 
 
500 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.38 
 
 
445 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  32.69 
 
 
444 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  32.19 
 
 
442 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  31.99 
 
 
445 aa  216  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  32.2 
 
 
444 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.49 
 
 
442 aa  216  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  32.56 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.35 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.43 
 
 
444 aa  213  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  31.73 
 
 
443 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  31.98 
 
 
443 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  32.62 
 
 
442 aa  211  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30.92 
 
 
443 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 
441 aa  210  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  31.72 
 
 
449 aa  208  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  32.53 
 
 
443 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  30.13 
 
 
437 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  31.74 
 
 
451 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.76 
 
 
443 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  31.63 
 
 
446 aa  207  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  31.8 
 
 
450 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  32.05 
 
 
451 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 
456 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  32.26 
 
 
444 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  30.26 
 
 
447 aa  203  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  31.12 
 
 
451 aa  203  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  28.45 
 
 
445 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  30.82 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  29.3 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  30.51 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  32.17 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  31.68 
 
 
449 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  29.27 
 
 
444 aa  200  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.02 
 
 
444 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  33.63 
 
 
468 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  31.01 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  31.29 
 
 
454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  32.14 
 
 
447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  32.33 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  31.43 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 
448 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  31.21 
 
 
444 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  30.92 
 
 
452 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  32.48 
 
 
444 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  31.85 
 
 
444 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  29.29 
 
 
447 aa  196  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.44 
 
 
444 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  30.25 
 
 
444 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  31.67 
 
 
447 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 
442 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  30.99 
 
 
444 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  32.89 
 
 
461 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  29.94 
 
 
440 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2031  glutamate--ammonia ligase  31.17 
 
 
451 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.794004  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0377  L-glutamine synthetase  31.17 
 
 
451 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  31.37 
 
 
464 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 
439 aa  194  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  30.92 
 
 
442 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  32.06 
 
 
455 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  31.34 
 
 
461 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  31.29 
 
 
444 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  32.77 
 
 
438 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  31.31 
 
 
445 aa  193  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  32.84 
 
 
444 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  30.43 
 
 
455 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  29.18 
 
 
442 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  31.29 
 
 
443 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
433 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2226  glutamine synthetase family protein  32.66 
 
 
456 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 
444 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.77 
 
 
450 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.75 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  29.53 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  29.72 
 
 
449 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  29.53 
 
 
476 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.17 
 
 
444 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  30.8 
 
 
475 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  29.94 
 
 
444 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>