More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3196 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  71.11 
 
 		 447 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 455 aa  938    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  65.55 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  66.08 
 
 		 455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  68.57 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  62.12 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  63.84 
 
 		 457 aa  586  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  65.4 
 
 		 483 aa  587  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  62.42 
 
 		 459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  62.95 
 
 		 464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  61.79 
 
 		 455 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  61.79 
 
 		 455 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  61.57 
 
 		 455 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  61.78 
 
 		 493 aa  565  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  56.03 
 
 		 460 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  51.11 
 
 		 454 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  50.43 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  55.05 
 
 		 470 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  51.42 
 
 		 455 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  49.56 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  50.44 
 
 		 459 aa  431  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  52.11 
 
 		 453 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  48.78 
 
 		 454 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  49.56 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  48.58 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  48.89 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  48.33 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  47.68 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  49.89 
 
 		 458 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  47.68 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  48.24 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  44.74 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  47.82 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  47.82 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  48.12 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  47.14 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  46.71 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  44.84 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  40.52 
 
 		 468 aa  332  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  41.46 
 
 		 461 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  39.06 
 
 		 466 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  38.84 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  38.84 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  32.58 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  36.78 
 
 		 471 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  34.61 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  34.6 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  33.77 
 
 		 457 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  33.78 
 
 		 457 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  32.44 
 
 		 457 aa  229  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  33.04 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  32.96 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  36.82 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  34.13 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.04 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  35.1 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  32.96 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  32.96 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  32.8 
 
 		 447 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  32.89 
 
 		 461 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  32.52 
 
 		 464 aa  206  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  32.21 
 
 		 476 aa  206  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  32.21 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  32.74 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  35.43 
 
 		 446 aa  203  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  32.96 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  35.43 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  32.04 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  31.97 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  32.46 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  34.82 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  32.74 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  32.87 
 
 		 447 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.07 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  32.07 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  31.46 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1774  hypothetical protein  31.58 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  36.08 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  32.96 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  30.39 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  31.48 
 
 		 476 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  30.31 
 
 		 439 aa  197  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4399  glutamine synthetase, putative  33.1 
 
 		 413 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  32.06 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  31.62 
 
 		 479 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  33.93 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  32.58 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  31.02 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  32.17 
 
 		 461 aa  193  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  32.45 
 
 		 444 aa  193  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  34.75 
 
 		 445 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  34.75 
 
 		 445 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  34.75 
 
 		 445 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  32.69 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  32.6 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  32.08 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  34.54 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>