More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4399 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4399  glutamine synthetase, putative  100 
 
 		 413 aa  847    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  84.47 
 
 		 447 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1774  hypothetical protein  80.63 
 
 		 447 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3492  glutamate--ammonia ligase  84.22 
 
 		 447 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.38104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  88.14 
 
 		 447 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  91.77 
 
 		 447 aa  788    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  99.03 
 
 		 440 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  97.34 
 
 		 440 aa  830    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20670  putative glutamine synthetase  80.87 
 
 		 413 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2858  glutamate--putrescine ligase  83.78 
 
 		 447 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0867431  normal  0.118351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34400  glutamine synthetase catalytic domain family protein  74.33 
 
 		 446 aa  627  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2138  glutamate--putrescine ligase  49.03 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000330057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2233  glutamate--ammonia ligase  49.27 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4519  hypothetical protein  49.27 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2188  glutamate--putrescine ligase  49.27 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000050762  unclonable  0.00000655518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2246  Glutamate--putrescine ligase  49.03 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000577408 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  42.96 
 
 		 476 aa  349  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  42.72 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  43.1 
 
 		 444 aa  345  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  42.96 
 
 		 476 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  43.31 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  42.18 
 
 		 463 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  44.34 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  42.86 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  43.93 
 
 		 475 aa  338  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  42.4 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  42.36 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  42.89 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  42.89 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  43.28 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  43.03 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  42.65 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  40.73 
 
 		 444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  40.73 
 
 		 444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  40.98 
 
 		 444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  41.91 
 
 		 452 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  41.91 
 
 		 452 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  43.2 
 
 		 449 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  42.12 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  41.87 
 
 		 445 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  42.16 
 
 		 452 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  41.87 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  42.16 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  41.99 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  42.2 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  42.2 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  42.2 
 
 		 445 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  43.69 
 
 		 467 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  42.4 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  40.98 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  42.4 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  41.67 
 
 		 452 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  42.16 
 
 		 452 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  41.99 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  42.16 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  41.67 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  42.4 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  43.87 
 
 		 453 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  41.95 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  42.47 
 
 		 444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  42.36 
 
 		 490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  41.63 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  42.36 
 
 		 444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  42.36 
 
 		 456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  42.47 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  41.42 
 
 		 456 aa  326  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  42.12 
 
 		 444 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  42.12 
 
 		 456 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  42.12 
 
 		 444 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  42.12 
 
 		 444 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  42.22 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  40.73 
 
 		 454 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  40.93 
 
 		 459 aa  322  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  42.58 
 
 		 450 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2903  glutamate--putrescine ligase  42.58 
 
 		 445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  42.21 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  41.91 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  41.99 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3517  glutamate--putrescine ligase  41.35 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3041  glutamate--ammonia ligase  42.34 
 
 		 445 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  41.13 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  41.22 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3013  glutamate--putrescine ligase  42.09 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.404896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  40.58 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6343  L-glutamine synthetase  42.09 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2380  glutamate--ammonia ligase  42.09 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2919  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000934315  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2994  glutamate--ammonia ligase  42.09 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3098  L-glutamine synthetase  40.82 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  41.79 
 
 		 451 aa  317  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  41.02 
 
 		 478 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2988  glutamate--putrescine ligase  42.26 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1107  glutamate--ammonia ligase  40.34 
 
 		 451 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000899819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  40.58 
 
 		 451 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1165  glutamate--putrescine ligase  40.34 
 
 		 451 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1198  glutamate--putrescine ligase  40.34 
 
 		 451 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3193  Glutamate--putrescine ligase  40.34 
 
 		 451 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0866318  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  40.24 
 
 		 454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3032  glutamate--ammonia ligase  40.82 
 
 		 451 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>