More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2319 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 459 aa  959    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  66.81 
 
 		 454 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  90.41 
 
 		 459 aa  885    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 459 aa  959    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  65.05 
 
 		 455 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  65 
 
 		 455 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  65.27 
 
 		 454 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  62.31 
 
 		 453 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  64.13 
 
 		 453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  58.61 
 
 		 455 aa  571  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  58.17 
 
 		 455 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  58.91 
 
 		 456 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  58.55 
 
 		 450 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  56.14 
 
 		 452 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  58.57 
 
 		 455 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  52.44 
 
 		 426 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  48.69 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  49.23 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  48.26 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  48.9 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  47.69 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  47.72 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  47.82 
 
 		 455 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  50.87 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  49.68 
 
 		 463 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  47.37 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  48.35 
 
 		 483 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  48.34 
 
 		 458 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  45.14 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  46.75 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  45.73 
 
 		 493 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  46.78 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  46.78 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  46.78 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  43.33 
 
 		 460 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  43.6 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  41.26 
 
 		 535 aa  318  9e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  38.77 
 
 		 468 aa  309  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  38.43 
 
 		 459 aa  302  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  37.34 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  34.72 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  34.78 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  35.16 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  35.16 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  34.29 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  36.01 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  37 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  36.01 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  36.01 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  36.48 
 
 		 457 aa  242  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  34.23 
 
 		 458 aa  242  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  34.53 
 
 		 455 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  35.75 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  36.67 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  35.31 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  33.51 
 
 		 439 aa  209  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  31.64 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  36.5 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  36.34 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.03 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  35.92 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  33.42 
 
 		 446 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  36.15 
 
 		 445 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  34.26 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  35.81 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  34.85 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  33.16 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  33.16 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.32 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  32.54 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  35.38 
 
 		 445 aa  199  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.03 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  34.84 
 
 		 447 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30.95 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  33.64 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  36.13 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  35.38 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  35.46 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.62 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  35.2 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  32.38 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  34.86 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  32.38 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  34.9 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.25 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  33.49 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  34.69 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  35.88 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.6 
 
 		 447 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  33.77 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 		 443 aa  193  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  33.64 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  33.59 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  33.76 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  34.27 
 
 		 455 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  30.87 
 
 		 479 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  34.54 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  33.16 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>