More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12876 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  74.45 
 
 		 469 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  72.44 
 
 		 459 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  74.39 
 
 		 455 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  74.39 
 
 		 455 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  100 
 
 		 457 aa  937    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  74.39 
 
 		 455 aa  702    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  64.13 
 
 		 447 aa  587  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  63.25 
 
 		 455 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  62.72 
 
 		 455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  64.54 
 
 		 454 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  61.35 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  58.85 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  61.11 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  56.29 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  54.38 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  52.44 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  51.7 
 
 		 535 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  51 
 
 		 454 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  48.34 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  48.34 
 
 		 455 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  48 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  50.11 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  50.11 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  48.78 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  47.61 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  47.57 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  48.32 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  48.32 
 
 		 455 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  46.34 
 
 		 450 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  48.26 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  48.26 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  48.12 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  42.83 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  46 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  45.23 
 
 		 453 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  44.25 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  44.25 
 
 		 463 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  42.76 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  43.31 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  43.05 
 
 		 468 aa  329  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  35.57 
 
 		 452 aa  266  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  39.26 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  39.26 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  39.26 
 
 		 466 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  34.82 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  34.84 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  36.53 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  34.02 
 
 		 458 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2888  Glutamate--ammonia ligase  34.15 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  33.18 
 
 		 457 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  34.98 
 
 		 457 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  32.96 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  34.54 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  33.03 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  35.16 
 
 		 455 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  33.18 
 
 		 452 aa  199  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.9 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  34.81 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  34.81 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  34.81 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  35.18 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  36.27 
 
 		 456 aa  196  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  36.27 
 
 		 444 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  33.41 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  36.27 
 
 		 444 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  36.27 
 
 		 444 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  36 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  36 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  36 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  32.32 
 
 		 446 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06870  Glutamine synthetase, putative  31.51 
 
 		 482 aa  192  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1774  hypothetical protein  30.87 
 
 		 447 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  32.72 
 
 		 451 aa  193  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  35.73 
 
 		 456 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  34.9 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  31.79 
 
 		 476 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  31.76 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  33.68 
 
 		 440 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  34.59 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  31.36 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  34.37 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20670  putative glutamine synthetase  32.89 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  31.57 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  33.93 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06654  glutamine synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03530)  30.87 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4399  glutamine synthetase, putative  33.93 
 
 		 413 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  33.95 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  34.99 
 
 		 445 aa  190  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  33.04 
 
 		 444 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  32.15 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  34.5 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  34.84 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  34.57 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  33.92 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  34.67 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  34.5 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  34.84 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  31.57 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>