More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06870 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06870  Glutamine synthetase, putative  100 
 
 		 482 aa  1003    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06654  glutamine synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03530)  50.73 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  42.77 
 
 		 457 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  42.37 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  42.86 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  40.46 
 
 		 458 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  39.7 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  37.83 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  37.83 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  37.06 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  38.39 
 
 		 455 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  37.28 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  35.08 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  33.47 
 
 		 466 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  33.47 
 
 		 466 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  33.04 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  32.99 
 
 		 458 aa  213  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  32.41 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  30.15 
 
 		 459 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  31.29 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  31.82 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  30.42 
 
 		 459 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  31.5 
 
 		 457 aa  196  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  30.96 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  31.21 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  31.66 
 
 		 454 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  31.82 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  31.29 
 
 		 493 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  32.63 
 
 		 455 aa  193  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  30.79 
 
 		 450 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  30.57 
 
 		 470 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  31 
 
 		 455 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  30.58 
 
 		 535 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  31.33 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  31.29 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  29.96 
 
 		 469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  29.32 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  30.2 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  31.07 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  29.91 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  29.91 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  30.63 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  29.91 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  30.63 
 
 		 454 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  30.85 
 
 		 455 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0611  glutamate--ammonia ligase  30.36 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  30.17 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  31.25 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  31.25 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  30.38 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  28.39 
 
 		 474 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  30.57 
 
 		 454 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  30.87 
 
 		 475 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  30.91 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  30.91 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  30.59 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  27.97 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  29.4 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  29.96 
 
 		 459 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  27.97 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  30.33 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  29.6 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  29.6 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  29.6 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  28.63 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  29.52 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  29.52 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  27.75 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  29.39 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  29.52 
 
 		 476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  28.75 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.19 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  29.71 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  29.2 
 
 		 449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0800  glutamine synthetase  29.07 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44189  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  28.96 
 
 		 445 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  28.33 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  30.21 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1121  glutamate--ammonia ligase  28 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  28.96 
 
 		 445 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  29.86 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1423  Glutamate--ammonia ligase  28.68 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  26.95 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  29.4 
 
 		 436 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  29.3 
 
 		 476 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  27.74 
 
 		 446 aa  160  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  28.6 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  28.33 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  28.54 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  26.15 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  31.03 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  31.35 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  29.57 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  26.74 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  29.23 
 
 		 454 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  30.73 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  31.59 
 
 		 446 aa  156  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  30.07 
 
 		 445 aa  156  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  26.74 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>