More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0732 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  100 
 
 
455 aa  952    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  99.56 
 
 
455 aa  949    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  91.01 
 
 
456 aa  879    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  65.11 
 
 
454 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  64.44 
 
 
454 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  62.22 
 
 
455 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  63.74 
 
 
455 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  61.64 
 
 
452 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  56.86 
 
 
459 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  58.61 
 
 
459 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  58.61 
 
 
459 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  57.58 
 
 
455 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  54.77 
 
 
450 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  54.95 
 
 
453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  57.04 
 
 
426 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  54.73 
 
 
453 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  49.89 
 
 
458 aa  438  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  48.79 
 
 
459 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  48.34 
 
 
457 aa  425  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  47.24 
 
 
455 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  49.11 
 
 
458 aa  412  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  49.12 
 
 
463 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  47.23 
 
 
446 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  49.67 
 
 
454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  47.68 
 
 
455 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  46.12 
 
 
447 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  45.63 
 
 
469 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  45.3 
 
 
459 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  46.46 
 
 
464 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  47.23 
 
 
483 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  45.71 
 
 
455 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  45.71 
 
 
455 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  45.71 
 
 
455 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  46.26 
 
 
493 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  43.2 
 
 
460 aa  359  7e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  43.08 
 
 
470 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  38.29 
 
 
459 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  38.41 
 
 
535 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  37.67 
 
 
468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  37.44 
 
 
461 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  35.71 
 
 
457 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  34.44 
 
 
452 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 
460 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  33.26 
 
 
458 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  36.49 
 
 
466 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  38.16 
 
 
466 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  38.16 
 
 
466 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  33.72 
 
 
471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  31.33 
 
 
457 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  31.33 
 
 
457 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  32.16 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  31.17 
 
 
444 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  31.86 
 
 
449 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  31.39 
 
 
444 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  31.1 
 
 
455 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  30.27 
 
 
455 aa  203  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  31.17 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  34.97 
 
 
449 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  32.58 
 
 
445 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  31.18 
 
 
449 aa  196  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  29.28 
 
 
437 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  30.11 
 
 
476 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  32.03 
 
 
456 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  29.72 
 
 
452 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 
445 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  30.59 
 
 
448 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  30.09 
 
 
486 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  31.42 
 
 
466 aa  193  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  33.42 
 
 
445 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  33.26 
 
 
444 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  33.26 
 
 
444 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  33.26 
 
 
444 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  33.26 
 
 
456 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  30.15 
 
 
452 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 
443 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  33.85 
 
 
445 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  33.03 
 
 
444 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  29.5 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  33.03 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  29.5 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  33.03 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  30.44 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  32.36 
 
 
445 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  32.36 
 
 
445 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  32.36 
 
 
445 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  32.39 
 
 
447 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  33.03 
 
 
456 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  30.54 
 
 
479 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  32.06 
 
 
444 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
450 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  31.35 
 
 
445 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  32.46 
 
 
446 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  31.99 
 
 
451 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  29.75 
 
 
449 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  32.13 
 
 
445 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  33.68 
 
 
443 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  32.92 
 
 
444 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  31.93 
 
 
451 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  31.45 
 
 
451 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  31.69 
 
 
445 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>