More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0657 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  100 
 
 		 470 aa  942    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  68.17 
 
 		 535 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  56.29 
 
 		 457 aa  491  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  58.37 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  55.05 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  51.93 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  53.9 
 
 		 447 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  51.61 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  51.61 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  52.75 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  51.61 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  51.36 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  51.65 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  54.59 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  52.28 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  52.17 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  52.06 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  44.57 
 
 		 454 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  46.36 
 
 		 455 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  44.1 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  43.08 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  43.08 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  43.08 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  43.54 
 
 		 455 aa  352  8e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  42.6 
 
 		 452 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  41.96 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  46.26 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  40.5 
 
 		 458 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  42.86 
 
 		 454 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  44.24 
 
 		 458 aa  336  5e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  43.6 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  43.6 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  42.54 
 
 		 463 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  42.4 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  42.86 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  42.14 
 
 		 450 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  42.79 
 
 		 453 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  42.52 
 
 		 426 aa  319  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  41.95 
 
 		 461 aa  299  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  41.28 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  33.86 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  41.01 
 
 		 466 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  40.74 
 
 		 466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  40.74 
 
 		 466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  35.46 
 
 		 458 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  33.98 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  35.83 
 
 		 460 aa  243  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  36.45 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  32.88 
 
 		 457 aa  223  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  32.65 
 
 		 457 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  38.86 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2888  Glutamate--ammonia ligase  34.68 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 		 457 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  34.46 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  33.17 
 
 		 439 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  33.62 
 
 		 455 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.46 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  36.01 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  31.44 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  35.75 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  35.32 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06870  Glutamine synthetase, putative  30.45 
 
 		 482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  35.53 
 
 		 446 aa  200  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  36.88 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  34.57 
 
 		 441 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  35.42 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  31.65 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1774  hypothetical protein  32.96 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  33.63 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  36.53 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3960  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 		 440 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1455  glutamate--putrescine ligase  32.52 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  33.07 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20670  putative glutamine synthetase  34.13 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  32.13 
 
 		 476 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06654  glutamine synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03530)  31.77 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4399  glutamine synthetase, putative  34.67 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  31.65 
 
 		 447 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  35.16 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  33.68 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  34.73 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  31.59 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  37.5 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  32.57 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3492  glutamate--ammonia ligase  33.41 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.38104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  32.57 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  34.56 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  31.59 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  33.77 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.62 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  34.29 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  31.93 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4259  L-glutamine synthetase  32.51 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  35.11 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  35.11 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  32.64 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  37.35 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  34.88 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>