More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2888 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2888  Glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 454 aa  929    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  37.79 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  34.15 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  32.29 
 
 		 474 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  31.35 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  32.74 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  31.24 
 
 		 455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  32.72 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  31.24 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  31.24 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  34.22 
 
 		 455 aa  199  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  31.01 
 
 		 455 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  34.68 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  30.98 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  32.26 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  32.1 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  31.91 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  31.21 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  30.42 
 
 		 458 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  31.22 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  30.66 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  30.84 
 
 		 455 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  32.11 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  29.68 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  30.72 
 
 		 453 aa  186  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  31.87 
 
 		 450 aa  186  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  31.19 
 
 		 454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  31.95 
 
 		 455 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  31.71 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  32.27 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  31.72 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  31.12 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  30.39 
 
 		 535 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  30.53 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  31.47 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  30.56 
 
 		 445 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 459 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  33.25 
 
 		 442 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  29.95 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  32.49 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.06 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  29.32 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  28.51 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  30.43 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.71 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  30.96 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  30 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  28.28 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  31.65 
 
 		 449 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  31.08 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  30.72 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  31.19 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  30.71 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  29.52 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.22 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  29.7 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  28.46 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  30.02 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  30.96 
 
 		 455 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  30.89 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06654  glutamine synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03530)  30.11 
 
 		 478 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  29.07 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  30.89 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  30.5 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  31.7 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.47 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  31.39 
 
 		 445 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  30.02 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  31.03 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  32.18 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  32.23 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  31.16 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  31.05 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12251  glutamine synthetase glnA2  30.46 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  27.84 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  29.97 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  34.33 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  29.35 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  29.35 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  29.35 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  29.16 
 
 		 444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  28.83 
 
 		 460 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  29.44 
 
 		 443 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  30.79 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  31.14 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 		 445 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  29.31 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  28.92 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  30.3 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  29.08 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  28.61 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  28.6 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  28.6 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  29.07 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  29.07 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  29.07 
 
 		 446 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  29.91 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>