More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4547 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 453 aa  943    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  64.13 
 
 		 459 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  62.69 
 
 		 454 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  63.33 
 
 		 455 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0993  glutamate--ammonia ligase  64.13 
 
 		 459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2319  L-glutamine synthetase  64.13 
 
 		 459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  59.11 
 
 		 450 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2633  glutamine synthetase catalytic region  60.04 
 
 		 454 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0200628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2893  Glutamate--ammonia ligase  59.34 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.893589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  59.6 
 
 		 453 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  54.51 
 
 		 456 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  54.73 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  54.73 
 
 		 455 aa  514  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  54.2 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  56.24 
 
 		 455 aa  501  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01963  glutamine synthetase family protein  50.35 
 
 		 426 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00039077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  50.11 
 
 		 457 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  52.11 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  51.78 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  50.33 
 
 		 469 aa  428  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2076  Glutamate--ammonia ligase  53.51 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  47.38 
 
 		 455 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  50.11 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  49.89 
 
 		 447 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  50.44 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  49.11 
 
 		 446 aa  415  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  48.78 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  48.78 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  48.78 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  48.34 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4670  glutamine synthetase catalytic region  46.8 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2587  L-glutamine synthetase  48.01 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  48 
 
 		 493 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1965  glutamine synthetase catalytic region  47.03 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0657  glutamate--putrescine ligase  46.26 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178319  normal  0.618001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4416  Glutamate--putrescine ligase  43.33 
 
 		 460 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.163105  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4059  L-glutamine synthetase  41.15 
 
 		 535 aa  322  7e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  41.23 
 
 		 468 aa  316  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0612  glutamate--ammonia ligase  37.75 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  39.82 
 
 		 461 aa  295  9e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  34.84 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  39.87 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  39.87 
 
 		 466 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  39.64 
 
 		 466 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  33.63 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  39.43 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  35.76 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  36.88 
 
 		 444 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  32.37 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.91 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  32.28 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  40.41 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  38.72 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  34.6 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  36.57 
 
 		 442 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  34.72 
 
 		 475 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  31.42 
 
 		 457 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  34.97 
 
 		 445 aa  229  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  31.19 
 
 		 457 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  38.72 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  35.92 
 
 		 441 aa  226  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  36.5 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  36.72 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0676  L-glutamine synthetase  32.08 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.291312  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  36.58 
 
 		 461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  34.16 
 
 		 461 aa  223  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  33.26 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  35.64 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  32 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  36.55 
 
 		 453 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  36.22 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  35.96 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  34.2 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2101  glutamine synthetase catalytic region  32.65 
 
 		 455 aa  217  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00945274  normal  0.235579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  32.46 
 
 		 476 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  34.85 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  34.57 
 
 		 475 aa  216  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.72 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  34.38 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  35.24 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  32.02 
 
 		 476 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  35.17 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  34.75 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.99 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  31.6 
 
 		 439 aa  216  9e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.69 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  38.27 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  34.49 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  32.02 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  33.41 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  37.08 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  37.15 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  35.92 
 
 		 439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  32.25 
 
 		 448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  37.18 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  33.56 
 
 		 486 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  37.4 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  35.77 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.81 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>