More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3850 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  100 
 
 
453 aa  936    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  55.21 
 
 
461 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  48.32 
 
 
433 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  37 
 
 
449 aa  256  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  36.5 
 
 
454 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  35.75 
 
 
452 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0350  glutamate--ammonia ligase  35.48 
 
 
455 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0380504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  34.73 
 
 
456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  35.8 
 
 
475 aa  242  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  34.44 
 
 
452 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  33.78 
 
 
452 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  34 
 
 
452 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  35.04 
 
 
453 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  33.78 
 
 
452 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0825  glutamate--ammonia ligase  35.25 
 
 
456 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.951182  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  34.87 
 
 
452 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  34.87 
 
 
452 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  35.1 
 
 
475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1093  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 
451 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0972  glutamate--ammonia ligase  33.92 
 
 
449 aa  236  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00809428  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  34.72 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  34.72 
 
 
452 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  34.71 
 
 
452 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  33.99 
 
 
452 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  34.44 
 
 
476 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2864  glutamate--ammonia ligase  34.14 
 
 
459 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317185  normal  0.149371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3193  Glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0866318  normal  0.0139402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1198  glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000128825  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1165  glutamate--putrescine ligase  33.11 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1107  glutamate--ammonia ligase  33.11 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000899819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  33.99 
 
 
452 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1901  L-glutamine synthetase  34.51 
 
 
454 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.643842  normal  0.247036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1130  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 
449 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  33.63 
 
 
444 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2919  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 
451 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000934315  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3098  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 
451 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000533566  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1268  glutamine synthetase  33.48 
 
 
451 aa  231  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  33.85 
 
 
444 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  33.77 
 
 
452 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  33.85 
 
 
444 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  34.02 
 
 
478 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  33.77 
 
 
452 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3001  L-glutamine synthetase  33.04 
 
 
451 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000079724  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3011  glutamate--ammonia ligase  32.23 
 
 
451 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.858612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  33.41 
 
 
476 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0942  L-glutamine synthetase  33.56 
 
 
444 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  33.18 
 
 
476 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1946  glutamine synthetase family protein  33.19 
 
 
444 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0912905  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5549  glutamate--ammonia ligase  33.94 
 
 
444 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4666  Glutamate--putrescine ligase  33.33 
 
 
444 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1739  glutamate--putrescine ligase  34.22 
 
 
454 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000378796 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  34 
 
 
461 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  33.71 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  34 
 
 
468 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1107  glutamate--putrescine ligase  34.37 
 
 
445 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0907011  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5473  L-glutamine synthetase  34.37 
 
 
445 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393385  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1060  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 
449 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0974728  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1838  L-glutamine synthetase  34.34 
 
 
455 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0277584  normal  0.270137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1340  Glutamate--putrescine ligase  34.43 
 
 
464 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5914  glutamate--ammonia ligase  33.71 
 
 
444 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1939  glutamate--putrescine ligase  32.89 
 
 
467 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0199472  normal  0.0178394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0945  glutamate--putrescine ligase  32.37 
 
 
449 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  33.62 
 
 
476 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1828  glutamine synthetase family protein  33.41 
 
 
456 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2654  glutamine synthetase  33.41 
 
 
444 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  36.1 
 
 
444 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  32.23 
 
 
451 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  32.66 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  33.12 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2181  glutamate--putrescine ligase  33.92 
 
 
445 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113907  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5914  glutamate--ammonia ligase  33.92 
 
 
445 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  33.92 
 
 
445 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1921  glutamine synthetase  34.3 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2711  glutamine synthetase catalytic domain  33.48 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0656  glutamine synthetase family protein  33.48 
 
 
456 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2788  glutamine synthetase family protein  33.48 
 
 
490 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1669  glutamine synthetase family protein  33.48 
 
 
444 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2355  glutamine synthetase family protein  33.48 
 
 
444 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2930  glutamine synthetase family protein  33.48 
 
 
444 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1192  L-glutamine synthetase  34.07 
 
 
455 aa  220  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 
445 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3032  glutamate--ammonia ligase  32.32 
 
 
451 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  32.55 
 
 
486 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.39 
 
 
442 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  35.54 
 
 
445 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2079  glutamate--putrescine ligase  34.07 
 
 
445 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114961  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2201  glutamate--ammonia ligase  33.92 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3517  glutamate--putrescine ligase  34.74 
 
 
445 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.164982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  30.94 
 
 
458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  30.94 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  33.26 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1397  glutamate--ammonia ligase  32.48 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  33.41 
 
 
466 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1252  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
450 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0538  glutamate--putrescine ligase  32.96 
 
 
446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  32.43 
 
 
446 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1121  glutamate--ammonia ligase  32.46 
 
 
448 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320088  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3740  glutamate--putrescine ligase  33.63 
 
 
447 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.120298  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  31.39 
 
 
460 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2233  glutamate--ammonia ligase  35.18 
 
 
444 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000137712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>