More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7497 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  100 
 
 
445 aa  899    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  61.4 
 
 
449 aa  550  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  46.45 
 
 
444 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  34.67 
 
 
442 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.59 
 
 
444 aa  249  7e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  34.08 
 
 
442 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  34.24 
 
 
449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  35.02 
 
 
445 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 
446 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.35 
 
 
445 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  34.44 
 
 
446 aa  237  4e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.55 
 
 
445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  35.68 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  34.07 
 
 
443 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  34.14 
 
 
446 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  34.36 
 
 
443 aa  232  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 
443 aa  230  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.11 
 
 
447 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  37.25 
 
 
468 aa  229  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  32.6 
 
 
439 aa  229  8e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 
442 aa  229  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  33.92 
 
 
446 aa  227  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  35.04 
 
 
435 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  33.55 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  32.6 
 
 
456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 
441 aa  226  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  33.33 
 
 
456 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  36.3 
 
 
461 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
443 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  31.99 
 
 
447 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 
443 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  33.19 
 
 
444 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  35.93 
 
 
435 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.67 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.03 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  32.67 
 
 
442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3944  glutamate--putrescine ligase  34.28 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.67 
 
 
444 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  32.29 
 
 
441 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  30.84 
 
 
445 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  33.48 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  32.89 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  36.22 
 
 
435 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 
446 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  33.04 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  35.85 
 
 
466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  35.85 
 
 
466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  35.85 
 
 
466 aa  217  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  35.99 
 
 
433 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  34.7 
 
 
435 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  34.81 
 
 
444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 
433 aa  216  8e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  32.3 
 
 
448 aa  216  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  32.67 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.42 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  32.29 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  32.52 
 
 
444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  31.63 
 
 
456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  32.44 
 
 
443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  33.92 
 
 
454 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  34.3 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  31.28 
 
 
439 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 
461 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  31.84 
 
 
442 aa  213  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  31.35 
 
 
444 aa  213  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  32.23 
 
 
443 aa  213  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  34.8 
 
 
444 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  34.95 
 
 
444 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  34.58 
 
 
435 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  32.52 
 
 
439 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  32.59 
 
 
444 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  31.66 
 
 
447 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  32.01 
 
 
443 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  34.22 
 
 
452 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  34.77 
 
 
444 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  32.01 
 
 
444 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 
450 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  35.4 
 
 
453 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  34.88 
 
 
452 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  32.01 
 
 
444 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  32.01 
 
 
444 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  33.84 
 
 
453 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 
444 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  31.79 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  32.01 
 
 
441 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 
444 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6419  glutamate--putrescine ligase  33.86 
 
 
444 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  33.02 
 
 
458 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  34.22 
 
 
452 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  32.68 
 
 
443 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  33.33 
 
 
475 aa  208  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>