More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8463 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0878  L-glutamine synthetase  68.81 
 
 		 479 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1176  glutamine synthetase catalytic region  76.1 
 
 		 486 aa  771    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2269  glutamate--ammonia ligase  75.73 
 
 		 476 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0828356  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8463  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 478 aa  981    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5153  L-glutamine synthetase  62.26 
 
 		 479 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.283926 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6981  glutamine synthetase catalytic region  63.18 
 
 		 478 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3191  L-glutamine synthetase  49.28 
 
 		 500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2132  L-glutamine synthetase  48.78 
 
 		 498 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0830  L-glutamine synthetase  46.14 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  44.9 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2204  glutamine synthetase, catalytic region  42.19 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0651857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2057  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2103  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183312  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  34.73 
 
 		 453 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2040  glutamate--ammonia ligase  33.12 
 
 		 455 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.373617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.8 
 
 		 445 aa  207  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  32.63 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  31.24 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4065  glutamate--ammonia ligase  32.69 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  31.85 
 
 		 456 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  31.24 
 
 		 449 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  33.61 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  33.61 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  33.61 
 
 		 466 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0679  L-glutamine synthetase  32.33 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 444 aa  197  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  32.15 
 
 		 457 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  30.44 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0715  glutamine synthetase family protein  31.71 
 
 		 476 aa  196  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0768  glutamine synthetase family protein  31.71 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.150739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  32.89 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  31.93 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  31.01 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3196  L-glutamine synthetase  33.62 
 
 		 455 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1760  Glutamate--ammonia ligase  32.61 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148642 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  32.26 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  31.38 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.48 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  30.88 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.87 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.48 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  31.85 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  28.81 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2278  glutamate--ammonia ligase  32.46 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3936  glutamate--putrescine ligase  31.35 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  33.55 
 
 		 449 aa  189  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  30.61 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4547  glutamate--ammonia ligase  30.54 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0732  glutamine synthetase family protein  30.43 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0686  glutamine synthetase family protein  30.43 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.22551  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  30.97 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  33.18 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2380  Glutamate--putrescine ligase  30.87 
 
 		 456 aa  187  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0068155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  30.97 
 
 		 432 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0295  putative glutamine synthetase  30.85 
 
 		 475 aa  187  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  31.3 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3881  glutamate--ammonia ligase  30.42 
 
 		 456 aa  186  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  30.61 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.27 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7784  glutamine synthetase catalytic region  29.62 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1637  Glutamate--putrescine ligase  31.3 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0634583  normal  0.087119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2006  Glutamate--putrescine ligase  30.44 
 
 		 449 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.349477  normal  0.804087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2393  glutamine synthetase, catalytic region  31.39 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1797  Glutamate--putrescine ligase  32.54 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1610  glutamate--ammonia ligase  30.75 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3857  Glutamate--ammonia ligase  32.26 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2794  glutamate--ammonia ligase  29.74 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0169506  normal  0.297978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  28.54 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0161  L-glutamine synthetase  30.82 
 
 		 475 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.636195  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  29.76 
 
 		 451 aa  183  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  30.64 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  27.39 
 
 		 445 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  30.84 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  28.63 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  28.78 
 
 		 443 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  29.2 
 
 		 443 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1870  L-glutamine synthetase  29.87 
 
 		 455 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1851  L-glutamine synthetase  31.04 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36214  normal  0.378692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0397  Glutamate--putrescine ligase  29 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2130  glutamine synthetase catalytic region  28.66 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1297  glutamate--putrescine ligase  29.45 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770979  normal  0.671991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  30.58 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  30.58 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  28.24 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  27.23 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  30.38 
 
 		 458 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0773  glutamate--ammonia ligase  31.95 
 
 		 458 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2783  L-glutamine synthetase  30.6 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3298  hypothetical protein  32.31 
 
 		 459 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0966227 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  29.36 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  28.18 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  28.18 
 
 		 444 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  30.6 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  28.24 
 
 		 447 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  31.87 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  33.04 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  29.79 
 
 		 444 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>