More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2916 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  100 
 
 		 469 aa  941    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  42.12 
 
 		 451 aa  339  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  40.71 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  46.4 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  32.24 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  34.79 
 
 		 445 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  37.95 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  37.12 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  33.55 
 
 		 444 aa  236  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  36.83 
 
 		 443 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  32.67 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  33.96 
 
 		 464 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  34.25 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  37.45 
 
 		 496 aa  230  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  34.06 
 
 		 453 aa  229  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  33.82 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  32.45 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  32.69 
 
 		 444 aa  226  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  33.05 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  35.59 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  34.36 
 
 		 452 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  33.92 
 
 		 445 aa  223  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  34.27 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  34.88 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  33.19 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  32.82 
 
 		 445 aa  220  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  32.7 
 
 		 453 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  29.71 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  34.01 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  34.78 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  34.39 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  34.55 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  35.05 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  35.7 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  34.11 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  30.97 
 
 		 433 aa  210  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  30.89 
 
 		 445 aa  209  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  32.69 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  31.43 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  32.1 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.61 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  31.02 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30.46 
 
 		 443 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  30.42 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  33.7 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  32.21 
 
 		 445 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  29.01 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  31.47 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  31.31 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  33.76 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  31.93 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  34.79 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  29.01 
 
 		 442 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  32.75 
 
 		 444 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  29.87 
 
 		 444 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  30.94 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  32.11 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  32.18 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  31.68 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.8 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  30.18 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  31.29 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  29.32 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  31.8 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  30.49 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  27.71 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  30.89 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  30.11 
 
 		 444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  31.25 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  29.85 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  32.54 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  29.12 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  31.07 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  30.02 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  31.73 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  28.13 
 
 		 448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  27.71 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  28.97 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  31.06 
 
 		 449 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  28.64 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  30.52 
 
 		 446 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  28.05 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  30.02 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  29.2 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  32.73 
 
 		 444 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  28.54 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  32.19 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.89 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  28.98 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  32.31 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  31.26 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  35.79 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  27.81 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  27.59 
 
 		 446 aa  190  5e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  32.25 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  29.17 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>