More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4491 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 
444 aa  905    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  49.89 
 
 
443 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  49.43 
 
 
443 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  48.97 
 
 
443 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  46.5 
 
 
439 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  40.09 
 
 
437 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  34.88 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  32.57 
 
 
448 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  32.02 
 
 
451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  33.78 
 
 
441 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  32.31 
 
 
496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  33.64 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  31.13 
 
 
453 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  29.63 
 
 
451 aa  156  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  32.12 
 
 
525 aa  156  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  29.81 
 
 
446 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  29.83 
 
 
456 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  30.57 
 
 
451 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  30.49 
 
 
456 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  31.32 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  30.24 
 
 
451 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  30.09 
 
 
445 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  31.64 
 
 
437 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.52 
 
 
444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 
444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 
445 aa  147  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  31.06 
 
 
452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  29.13 
 
 
444 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31 
 
 
443 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  31.4 
 
 
437 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  30.31 
 
 
444 aa  146  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  31.4 
 
 
437 aa  146  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  30.4 
 
 
444 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  32.76 
 
 
452 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  30.48 
 
 
445 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  31.35 
 
 
451 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  30.09 
 
 
445 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  29.82 
 
 
444 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  30.17 
 
 
446 aa  144  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  29.36 
 
 
444 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.06 
 
 
444 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  27.96 
 
 
444 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  29.69 
 
 
446 aa  143  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  30.66 
 
 
451 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  29.48 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  29.63 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  31.01 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  29.8 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  27.79 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  29.29 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  31.01 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  28.82 
 
 
444 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  29.23 
 
 
450 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  30 
 
 
441 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  27.68 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  30.21 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  28.9 
 
 
444 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  30.73 
 
 
444 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  29.41 
 
 
447 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  29.63 
 
 
453 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  29.29 
 
 
452 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  29.84 
 
 
453 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  28.94 
 
 
442 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  30.99 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  29.27 
 
 
452 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  28.95 
 
 
449 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  29.51 
 
 
455 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  28.98 
 
 
446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  28.73 
 
 
444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  28.84 
 
 
449 aa  136  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  29.4 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.4 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.4 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.4 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.4 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  34.67 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  30.24 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  28.24 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  28.21 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  28.74 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.4 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  28.02 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  28.92 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  29.18 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  30 
 
 
443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  31.42 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  29.79 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  29.72 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  28.24 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.13 
 
 
444 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  28.64 
 
 
439 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1793  glutamine synthetase, type I  35.85 
 
 
473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  28.88 
 
 
439 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.16 
 
 
445 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  28.65 
 
 
446 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  28.65 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  28.54 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  30.3 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  28.94 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  28.86 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>