More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2057 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 443 aa  904    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  66.74 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  65.61 
 
 		 443 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  48.97 
 
 		 444 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  38.62 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  41.74 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  34.11 
 
 		 469 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  31.98 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  32.7 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  35.36 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  33.1 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  32.87 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  32.87 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  33.02 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  32.76 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  28.86 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  31.37 
 
 		 496 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  33.5 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  28.86 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  33.5 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  33.5 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  30.73 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  31.27 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  31.32 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  30.6 
 
 		 445 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  29.11 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  30.42 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  30.19 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  32.01 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  31.61 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  34.87 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  28.27 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  28.84 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  31.87 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  27.63 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  28.77 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  34.05 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  31.49 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  29.03 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  26.28 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  29.7 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  28.94 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  26.96 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  28.77 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  28.38 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  28.86 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  27.66 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  27.5 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  29.92 
 
 		 445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.48 
 
 		 444 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  29.48 
 
 		 444 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  27.59 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  28.3 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  28.84 
 
 		 456 aa  132  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  29.48 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.25 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  29.48 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  29.25 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.48 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  27.25 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  27.27 
 
 		 443 aa  130  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  29.38 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  29.38 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  26.7 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  29.53 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  29.72 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  26.87 
 
 		 449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28.34 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  29.16 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  28.01 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  26.56 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  28.47 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  33.21 
 
 		 473 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.53 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  28.38 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  26.51 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  27.09 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  28.14 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  27.52 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  29.77 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  29.02 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  29.68 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  28.16 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  28.74 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2928  glutamine synthetase, type I  34.72 
 
 		 478 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.304351  normal  0.179293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  27.83 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  27.98 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  27.27 
 
 		 443 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  27.65 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  28.28 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1787  glutamate--ammonia ligase  26.78 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.683102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  27.49 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3320  L-glutamine synthetase  34.72 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.729723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>