More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5786 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 442 aa  864    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  57.38 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  50.98 
 
 		 525 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  44.87 
 
 		 455 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  36.78 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  38.16 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  38.16 
 
 		 450 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  38.07 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  37.93 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  37.12 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  37.12 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  37.12 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  35.81 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  38.64 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  31.25 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  34.85 
 
 		 469 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  32.04 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  35.06 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  34.91 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  35.88 
 
 		 441 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  33.18 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  35.2 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  30.77 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  31.84 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  29.7 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  28.28 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  28.64 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  29.89 
 
 		 449 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  27.43 
 
 		 865 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  27.29 
 
 		 450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  29.1 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.86 
 
 		 444 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  29.44 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  27.45 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  28.64 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  29.38 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  31.83 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  27.87 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.44 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  29.11 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  28.16 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  30.16 
 
 		 452 aa  142  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  30.05 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  30.26 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  30.17 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  29.04 
 
 		 435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  31.13 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  28.5 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  29.93 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  31.62 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  30.22 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  28.5 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  30 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  28.8 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  28.26 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  27.25 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7497  Glutamate--ammonia ligase  30.97 
 
 		 445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  28.47 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2888  Glutamate--ammonia ligase  30.09 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  25.69 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  28.51 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  28.64 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  25.97 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  28.61 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  28.8 
 
 		 435 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  29.1 
 
 		 432 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  29.45 
 
 		 445 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0302  glutamate--putrescine ligase  27.84 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  27.15 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  29.71 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  26.73 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1031  L-glutamine synthetase  31.13 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  27.54 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  27.34 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  26.5 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  27.06 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  25.51 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12876  glutamine synthetase glnA4  29.46 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  27.5 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  29 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  25.83 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  28.08 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  28.24 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  28.95 
 
 		 455 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0611  glutamate--ammonia ligase  32.41 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  27.68 
 
 		 474 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  25.59 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  25.59 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  25.59 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  25.83 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  29.2 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  25.59 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  29.02 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  25.59 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  25.59 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  25.83 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  25.42 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  25.83 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>