More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2920 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  76.8 
 
 		 437 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  76.8 
 
 		 437 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  76.8 
 
 		 437 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  100 
 
 		 442 aa  874    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  52.66 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  47.26 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  46.76 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  46.91 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  46.91 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  46.8 
 
 		 450 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  38.38 
 
 		 496 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  39.05 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  34.77 
 
 		 525 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  38.07 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  35.37 
 
 		 443 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  34.92 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  35.24 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  33.64 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  33.02 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  33.64 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  30.61 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  30.07 
 
 		 451 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1667  glutamine synthetase, catalytic region  27.69 
 
 		 474 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04819  Protein fluG [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38094]  27.85 
 
 		 865 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385753  normal  0.68223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1603  glutamate--ammonia ligase  32.33 
 
 		 468 aa  143  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  29.6 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2178  hypothetical protein  31.71 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2206  hypothetical protein  31.4 
 
 		 457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1446  L-glutamine synthetase  30.07 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  31.31 
 
 		 444 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  27.27 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  27.79 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4024  Glutamate--putrescine ligase  29.61 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  29.02 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  31.69 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  27.8 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  31.07 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4406  Glutamate--ammonia ligase  30.38 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  29.17 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  29.19 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  29.17 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  28.83 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0110  glutamine synthetase, catalytic region  27.89 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2918  glutamine synthetase protein  30.37 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  27.68 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  31.8 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  30.53 
 
 		 443 aa  126  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  29.28 
 
 		 444 aa  126  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0512  glutamate--ammonia ligase  29.61 
 
 		 466 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0523  glutamate--ammonia ligase  29.61 
 
 		 466 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  28.67 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0501  glutamate--ammonia ligase  29.61 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  28.67 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  29.85 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  29.61 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  31.86 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2502  L-glutamine synthetase  26.03 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.979847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.03 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  28.53 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  29.72 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00463  glutamine synthetase  27.5 
 
 		 461 aa  123  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.625789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  30.03 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  30.95 
 
 		 463 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  29.25 
 
 		 444 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  29.27 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  30.61 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2609  glutamate--ammonia ligase  30.19 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4121  Glutamate--ammonia ligase  29.17 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  28.83 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  27.33 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  30.13 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  25.29 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  28.14 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  29.33 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2532  hypothetical protein  29.57 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.877582  normal  0.863101 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  29.91 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3850  Glutamate--ammonia ligase  30.12 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274285  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  30.68 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  26.45 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  30.25 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  29.03 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  29.03 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  29.52 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48860  putative glutamine synthetase  27.25 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467779  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  25.94 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  29.52 
 
 		 447 aa  120  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  31.89 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  28.82 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  28.75 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  28.76 
 
 		 447 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4698  L-glutamine synthetase  26.09 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  28.9 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  27.05 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  26.22 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  25.94 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  26.83 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5139  Glutamate--ammonia ligase  30.54 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.551864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2644  glutamate--ammonia ligase  26.07 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  25.4 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  27.23 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>