More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4681 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  100 
 
 
451 aa  935    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  63.57 
 
 
448 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  54.09 
 
 
441 aa  458  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  42.12 
 
 
469 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.56 
 
 
441 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  32.89 
 
 
447 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 
444 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.74 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  33.03 
 
 
443 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  35.59 
 
 
455 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.48 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  35.95 
 
 
453 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  35.48 
 
 
496 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.87 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  31.19 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  34.21 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  31.66 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  32.54 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 
444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  32.56 
 
 
444 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  32.56 
 
 
444 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  32.56 
 
 
444 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  32.56 
 
 
444 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  32.56 
 
 
444 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  32.56 
 
 
444 aa  232  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  32.56 
 
 
444 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  30.75 
 
 
445 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 
444 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  31.85 
 
 
443 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 
444 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  34.75 
 
 
446 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  32.34 
 
 
456 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 
444 aa  227  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  33.71 
 
 
446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  33.41 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  30.5 
 
 
443 aa  226  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 
433 aa  226  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  32.67 
 
 
445 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  33.41 
 
 
445 aa  226  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  34.01 
 
 
445 aa  226  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  32.6 
 
 
444 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  33.69 
 
 
453 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  33.1 
 
 
456 aa  225  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 
451 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  32.41 
 
 
444 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  32.29 
 
 
447 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 
444 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  32.97 
 
 
452 aa  223  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 
450 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  33.63 
 
 
444 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  31.66 
 
 
446 aa  222  8e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
451 aa  222  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3262  glutamine synthetase catalytic region  33.04 
 
 
446 aa  222  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.216944  hitchhiker  0.00017757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  32.88 
 
 
445 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  31.18 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  32.44 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  30.68 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  32.97 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  30.72 
 
 
440 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  32.68 
 
 
445 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  32.97 
 
 
444 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  32.98 
 
 
453 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 
451 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4822  glutamine synthetase catalytic region  34.3 
 
 
448 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  31.78 
 
 
463 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  33.62 
 
 
453 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  32.37 
 
 
444 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  30.66 
 
 
442 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  31.57 
 
 
448 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  31.29 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  31.29 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  32.44 
 
 
447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  31.51 
 
 
446 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  31.79 
 
 
464 aa  217  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  32.41 
 
 
448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  32.89 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  30.89 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  33.71 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  31.56 
 
 
446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  32.31 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  30.79 
 
 
439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  32.07 
 
 
446 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  32.8 
 
 
451 aa  212  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  30.44 
 
 
457 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  31.28 
 
 
439 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  31.33 
 
 
446 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  32.88 
 
 
446 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  31.29 
 
 
442 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  31.85 
 
 
443 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  31.63 
 
 
443 aa  211  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 
446 aa  211  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  29.96 
 
 
443 aa  211  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 
446 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  32.59 
 
 
447 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  29.56 
 
 
442 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  32.97 
 
 
446 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  32.97 
 
 
446 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  32.97 
 
 
446 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.155742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>