More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72690 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6309  putative glutamine synthetase  95.26 
 
 		 443 aa  852    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72690  putative glutamine synthetase  100 
 
 		 443 aa  887    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0153069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2057  glutamine synthetase, catalytic region  66.74 
 
 		 443 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4491  glutamine synthetase catalytic region  49.89 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0411429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7851  glutamine synthetase catalytic region  45.98 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5349  glutamine synthetase catalytic region  40.56 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.791079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2916  glutamate-ammonia ligase  37.12 
 
 		 469 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0201  glutamine synthetase catalytic region  34.03 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0281454  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3286  hypothetical protein  36.79 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4681  L-glutamine synthetase  31.52 
 
 		 451 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.455375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  35.37 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0233  glutamine synthetase, catalytic region  34.74 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0719706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0243  glutamine synthetase, catalytic region  34.74 
 
 		 437 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.680627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0223  glutamine synthetase, catalytic region  34.98 
 
 		 437 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395034  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6502  glutamine synthetase catalytic region  32.97 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415769  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0315  L-glutamine synthetase  33.54 
 
 		 525 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.432555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  30.07 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  32.32 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  29.57 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1967  glutamine synthetase catalytic region  33.71 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  32.83 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  32.83 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5786  glutamine synthetase catalytic region  34.92 
 
 		 442 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0173  glutamine synthetase catalytic region  33.11 
 
 		 452 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  32.83 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  31.88 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  28.31 
 
 		 445 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  28.9 
 
 		 444 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  29.67 
 
 		 447 aa  153  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  28.14 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  32.82 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  28.5 
 
 		 441 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  28.54 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  29.04 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  27.25 
 
 		 444 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  28.9 
 
 		 445 aa  150  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  29.49 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  29.48 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  26.07 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0246  Glutamate--ammonia ligase  28.81 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  28.77 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  28.89 
 
 		 444 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  31.06 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  28.21 
 
 		 456 aa  146  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  29.01 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.49 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  28 
 
 		 448 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 444 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  30 
 
 		 453 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  28.21 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  30.93 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12210  L-glutamine synthetase  30.43 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000380356  normal  0.117276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  29.77 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  26.98 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0602  L-glutamine synthetase  30 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.328927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  28.45 
 
 		 444 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  28.17 
 
 		 443 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  27.84 
 
 		 456 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  26.71 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16570  L-glutamine synthetase  30.23 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.45489  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  29.63 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  28.57 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  26.89 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  31.41 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  27.06 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  28.51 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1096  L-glutamine synthetase  30.54 
 
 		 449 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  28.6 
 
 		 444 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  29.1 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  28.8 
 
 		 453 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  27.8 
 
 		 449 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  26.65 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  28.71 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  26.9 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  28.87 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  29.44 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  28.83 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  29.31 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  28.7 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1592  L-glutamine synthetase  29.72 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0667119  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  29.14 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  28.21 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0982  L-glutamine synthetase  28.77 
 
 		 453 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.624749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  27.06 
 
 		 443 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  27.04 
 
 		 449 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  29.13 
 
 		 450 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1901  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.624126  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 444 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  29.22 
 
 		 452 aa  136  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  30.09 
 
 		 446 aa  136  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  28.37 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  28.02 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1787  glutamate--ammonia ligase  26.98 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.683102  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  28.34 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  28.41 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  27.91 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  28.14 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>