More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0602 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0602  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 438 aa  897    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.328927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0246  Glutamate--ammonia ligase  59.58 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  31.04 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.11 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3763  glutamine synthetase, type I  30.58 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000243827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  29.89 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  29.93 
 
 		 445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  30.48 
 
 		 447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  31.22 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.45 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  32.24 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  31.66 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  31.64 
 
 		 456 aa  210  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  31.35 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  30.84 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.09 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  32.46 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  29.49 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  29.44 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  29.56 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  29.82 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  30.86 
 
 		 452 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  29.75 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2810  glutamate--ammonia ligase  30.72 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000780353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  29.98 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3996  glutamine synthetase, type I  28.95 
 
 		 443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  30.72 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  30.89 
 
 		 456 aa  200  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  29.56 
 
 		 446 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  30.18 
 
 		 445 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2909  glutamine synthetase, type I  31.99 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113408  normal  0.593319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  32.29 
 
 		 449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  28.44 
 
 		 445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  29.65 
 
 		 442 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  31.66 
 
 		 453 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  28.91 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  29.91 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  30.07 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  30.43 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  30.13 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1497  glutamine synthetase, type I  31.33 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.293618  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0159  glutamine synthetase  32.06 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.463093  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  31.92 
 
 		 451 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  29.13 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  29.69 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  31.89 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  30.22 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  30.22 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  29.44 
 
 		 439 aa  194  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3089  glutamine synthetase catalytic region  31.47 
 
 		 450 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  31.22 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  29.46 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1112  glutamine synthetase, type I  31.84 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.729434 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  30 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  29.15 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  31.85 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  29.72 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  31.89 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2047  glutamine synthetase, type I  31.1 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.945821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  29.86 
 
 		 443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  32.81 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  30.91 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  30.91 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  29.69 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1487  glutamine synthetase, type I  31.17 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3339  L-glutamine synthetase  31.32 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0399179  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3328  L-glutamine synthetase  31.32 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.954484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3390  L-glutamine synthetase  31.32 
 
 		 446 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  28.7 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  29.01 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  29.01 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  29.01 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  29.01 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  29.05 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  29.01 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  29.69 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  30.94 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  29.23 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  29.69 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  29.28 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  30.37 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  29.01 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  27.52 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  30.3 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  29.39 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  29.09 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  29.95 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  31.43 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  30.46 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  28.31 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  28.79 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0202  L-glutamine synthetase  28.97 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  28.32 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3598  glutamine synthetase, type I  30.65 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  32.73 
 
 		 446 aa  187  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  30.8 
 
 		 450 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  30.62 
 
 		 452 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19880  L-glutamine synthetase  28.92 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  28.44 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>