More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0583 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
166 aa  336  8e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0582  hypothetical protein  30.71 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000457357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.74 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.25 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  54 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.15 
 
 
171 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.25 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.33 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.2 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.58 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.7 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  51.85 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
172 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.5 
 
 
163 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  50.94 
 
 
140 aa  54.7  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54 
 
 
151 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.15 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  43.4 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  52 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.98 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.54 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.1 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.78 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.81 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  39.19 
 
 
158 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  29.55 
 
 
188 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  41.1 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.63 
 
 
163 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  44.68 
 
 
169 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  46.43 
 
 
187 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  52.38 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  44.68 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  64.1 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  57.45 
 
 
48 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  73.53 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  45.65 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  45.65 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  39.66 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  70.59 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  58.97 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  47.83 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  63.41 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  56.41 
 
 
182 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.45 
 
 
141 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  48 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.81 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.02 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.78 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  51.16 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.38 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.56 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  61.54 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  36.62 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  47.62 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  40 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  46.51 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  58.54 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.35 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  37.74 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  44.83 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  57.78 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  46.15 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  44.19 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  47.17 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  47.92 
 
 
141 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  38.98 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  60.53 
 
 
171 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  46.51 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  38.98 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.99 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.92 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  40.98 
 
 
169 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  47.73 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  43.4 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.15 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  40.91 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  52.17 
 
 
548 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  43.48 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  27.85 
 
 
148 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  45.1 
 
 
133 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  41.94 
 
 
174 aa  48.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  46.67 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  54.55 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  56.1 
 
 
567 aa  48.1  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  44.9 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  33.85 
 
 
176 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  44.9 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  38.33 
 
 
199 aa  48.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  46.94 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  38.71 
 
 
111 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>