More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2569 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2569  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 321 aa  645    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  47.73 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08200  small-conductance mechanosensitive channel  43.19 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.335106 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  35.75 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0383  MscS Mechanosensitive ion channel  38.96 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 345 aa  95.9  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  31.61 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  36.61 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1210  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  30.29 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  31.91 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0104  MscS mechanosensitive ion channel  26.2 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00989653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  36.18 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000167428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 507 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.45 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  36.51 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  33.01 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03115  MscS Mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  34.95 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.79 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  27.8 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  39.18 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4932  MscS Mechanosensitive ion channel  38.78 
 
 		 400 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 561 aa  66.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2568  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  38 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2935  MscS Mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.863949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12461  transmembrane protein  30.09 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  27.46 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1649  MscS Mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3612  MscS Mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.649067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4689  MscS Mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  24.88 
 
 		 1128 aa  62.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  30.48 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4608  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.247282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0108  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  34.29 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0691  MscS Mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  25.32 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 		 796 aa  61.2  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  23.2 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1940  MscS mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  26.54 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  34.95 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0623  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  28.43 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 832 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1822  MscS mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00396347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  24.46 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0172  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4819  MscS mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.749552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2171  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  28.39 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  24.29 
 
 		 444 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>