More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1181 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  28.34 
 
 
200 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  32.14 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  32.05 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  32.14 
 
 
211 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  31.55 
 
 
211 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  29.11 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  28.64 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  29.11 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  24.41 
 
 
215 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  30.34 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  30.34 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  30.29 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  28.49 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  27.17 
 
 
412 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 
844 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  30.51 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  29.03 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  26.04 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  26.63 
 
 
215 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.58 
 
 
449 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 
739 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 
739 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 
739 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 
521 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  27.63 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 
186 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  28.81 
 
 
183 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.03 
 
 
363 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 
193 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  24.26 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  23.24 
 
 
961 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 
290 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  22.42 
 
 
381 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  23.4 
 
 
320 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  29.27 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  27.47 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  31.16 
 
 
453 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  31.88 
 
 
452 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  31.16 
 
 
485 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
291 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  24.07 
 
 
171 aa  56.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  24.06 
 
 
187 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  29.58 
 
 
880 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 
880 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  22.94 
 
 
567 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5595  pentapeptide repeat protein  29.2 
 
 
221 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 
576 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  22.71 
 
 
309 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  24.48 
 
 
180 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 
340 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  28.05 
 
 
197 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  22.5 
 
 
267 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  27.88 
 
 
184 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3926  pentapeptide repeat protein  20.88 
 
 
430 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  25.66 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  27.06 
 
 
872 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  28.24 
 
 
242 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  27.71 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  24.08 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2059  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  24.84 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  25.41 
 
 
355 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 
880 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  32.21 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.77 
 
 
448 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 
880 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 
880 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  23.44 
 
 
976 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  25.18 
 
 
367 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  25.18 
 
 
367 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  27.63 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  26.97 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.58 
 
 
846 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.03 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  27.45 
 
 
877 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 
389 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  21.76 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5571  hypothetical protein  20.88 
 
 
430 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.422571  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2386  hypothetical protein  26.16 
 
 
199 aa  52.4  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.193618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  25.69 
 
 
197 aa  52.4  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 
205 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 
776 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  24.7 
 
 
215 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>