89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2249 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  71.61 
 
 		 1039 aa  1362    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  87.25 
 
 		 949 aa  1642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  100 
 
 		 948 aa  1886    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  93.67 
 
 		 948 aa  1766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  93.88 
 
 		 948 aa  1768    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  91.1 
 
 		 583 aa  1003    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  28.69 
 
 		 947 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1571 aa  138  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  34.69 
 
 		 1526 aa  137  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.69 
 
 		 1526 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1565 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  37.4 
 
 		 863 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  36.64 
 
 		 863 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  36.64 
 
 		 863 aa  115  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.92 
 
 		 1770 aa  115  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  36.64 
 
 		 836 aa  115  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  36.64 
 
 		 836 aa  115  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.64 
 
 		 836 aa  115  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 1748 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  30.81 
 
 		 1099 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  29.27 
 
 		 1770 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  29.64 
 
 		 1753 aa  108  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  29.38 
 
 		 1115 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  28.63 
 
 		 1040 aa  102  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.54 
 
 		 1093 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.54 
 
 		 1093 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.11 
 
 		 1762 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 		 1762 aa  97.8  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 1763 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.22 
 
 		 1067 aa  95.5  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  38.42 
 
 		 418 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  38.42 
 
 		 418 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  38.42 
 
 		 418 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  38.42 
 
 		 418 aa  92.4  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  38.42 
 
 		 418 aa  92.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.88 
 
 		 1070 aa  91.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  38.42 
 
 		 418 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  38.42 
 
 		 418 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  37.89 
 
 		 418 aa  91.3  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  37.37 
 
 		 418 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.7 
 
 		 1070 aa  90.1  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  27.58 
 
 		 825 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 		 819 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.82 
 
 		 1741 aa  75.5  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  44.86 
 
 		 914 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.26 
 
 		 1357 aa  73.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  45.87 
 
 		 864 aa  73.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  26.13 
 
 		 924 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  26.78 
 
 		 1234 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.03 
 
 		 909 aa  67.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.99 
 
 		 1197 aa  63.9  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  32 
 
 		 1049 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.57 
 
 		 1009 aa  63.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  31.49 
 
 		 1571 aa  63.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  25.42 
 
 		 1971 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  39.05 
 
 		 927 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  39.05 
 
 		 818 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  29.79 
 
 		 1068 aa  58.9  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  24.41 
 
 		 989 aa  56.6  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.95 
 
 		 1023 aa  55.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  24.71 
 
 		 950 aa  55.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  45.33 
 
 		 3635 aa  54.3  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 1268 aa  54.3  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.95 
 
 		 1055 aa  53.9  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 1593 aa  54.3  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  24.36 
 
 		 1012 aa  53.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.91 
 
 		 1285 aa  52.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 1108 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  31.16 
 
 		 995 aa  52.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  38.24 
 
 		 2057 aa  51.6  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  26.84 
 
 		 1254 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  26.84 
 
 		 1269 aa  51.2  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.69 
 
 		 1259 aa  51.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  26.62 
 
 		 1259 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  26.53 
 
 		 747 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  23.6 
 
 		 820 aa  49.3  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  30.57 
 
 		 1028 aa  49.3  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  32.35 
 
 		 773 aa  47.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  31.84 
 
 		 800 aa  47.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  26.29 
 
 		 4312 aa  46.2  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  40 
 
 		 1254 aa  45.8  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  39.34 
 
 		 1472 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  52.5 
 
 		 2396 aa  45.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  37.1 
 
 		 1446 aa  44.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  30.49 
 
 		 1250 aa  44.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  43.86 
 
 		 3322 aa  44.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  51.28 
 
 		 5613 aa  44.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  48.44 
 
 		 1009 aa  44.3  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.4 
 
 		 1250 aa  44.3  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>