168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2058 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  53.78 
 
 		 1853 aa  1870    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  47.77 
 
 		 1593 aa  817    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  57.39 
 
 		 1877 aa  1968    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  29.19 
 
 		 1622 aa  647    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  52.31 
 
 		 1854 aa  1878    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  100 
 
 		 1861 aa  3747    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  38.46 
 
 		 1559 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  38.25 
 
 		 1575 aa  570  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  39.74 
 
 		 1559 aa  562  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  40.62 
 
 		 1571 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1589 aa  513  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  36.48 
 
 		 1589 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1589 aa  503  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1572 aa  489  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  37.05 
 
 		 1328 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1888 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  44.01 
 
 		 1722 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  35.46 
 
 		 1904 aa  476  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  44.27 
 
 		 2096 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  37.23 
 
 		 1867 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  36.9 
 
 		 1958 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  36.25 
 
 		 2759 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  39.02 
 
 		 2197 aa  440  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  39.36 
 
 		 1991 aa  439  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  38.93 
 
 		 1980 aa  439  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  38.62 
 
 		 2204 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  40.3 
 
 		 1754 aa  433  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  37.47 
 
 		 1803 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  36.78 
 
 		 2207 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  34.28 
 
 		 2013 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  42.05 
 
 		 2016 aa  416  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  37.92 
 
 		 2222 aa  412  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  38.41 
 
 		 2198 aa  412  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  36.25 
 
 		 1973 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  37.67 
 
 		 1823 aa  413  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  35.9 
 
 		 1950 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  35.9 
 
 		 1958 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  35.52 
 
 		 1986 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  34.15 
 
 		 2002 aa  392  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  37.31 
 
 		 1983 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  42.88 
 
 		 2123 aa  393  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  35.43 
 
 		 1945 aa  380  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  42.61 
 
 		 1801 aa  379  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  43.06 
 
 		 2045 aa  380  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  33.65 
 
 		 1959 aa  380  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  29.64 
 
 		 2125 aa  269  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  29.64 
 
 		 2125 aa  269  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.6 
 
 		 1403 aa  265  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  32.47 
 
 		 1822 aa  262  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  37.45 
 
 		 1838 aa  258  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  35.7 
 
 		 2005 aa  253  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1822 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  30.87 
 
 		 1296 aa  191  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.68 
 
 		 1363 aa  174  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  32.94 
 
 		 2104 aa  166  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  31.99 
 
 		 1328 aa  165  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.6 
 
 		 1312 aa  164  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 2101 aa  162  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 2101 aa  162  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  31.02 
 
 		 2098 aa  161  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 2098 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  31.02 
 
 		 2098 aa  160  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1407 aa  149  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1392 aa  139  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  26.01 
 
 		 1367 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1400 aa  135  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  30.2 
 
 		 1489 aa  135  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1506 aa  132  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.72 
 
 		 1629 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1413 aa  126  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  26.97 
 
 		 1412 aa  121  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1254 aa  120  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  28.92 
 
 		 1649 aa  117  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1474 aa  116  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.51 
 
 		 1490 aa  116  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  24.59 
 
 		 1050 aa  115  6e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1499 aa  114  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  26.58 
 
 		 1285 aa  113  5e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1670 aa  112  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  26.5 
 
 		 1410 aa  110  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  27.43 
 
 		 1697 aa  107  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.02 
 
 		 1575 aa  104  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.94 
 
 		 1622 aa  103  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  28.39 
 
 		 1523 aa  103  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1652 aa  101  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  25.73 
 
 		 1790 aa  101  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  28.2 
 
 		 1630 aa  99.8  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  28.33 
 
 		 2622 aa  98.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  27.08 
 
 		 1387 aa  98.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1724 aa  95.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  32.6 
 
 		 194 aa  94  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  29.54 
 
 		 1694 aa  91.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1207 aa  84.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.13 
 
 		 906 aa  81.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.92 
 
 		 907 aa  80.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.64 
 
 		 905 aa  80.1  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.64 
 
 		 905 aa  79.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.45 
 
 		 900 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  27.16 
 
 		 905 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25.58 
 
 		 1121 aa  77  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>