124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0629 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 383 aa  766    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  56.92 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  55.87 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  58.75 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  58.05 
 
 		 385 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  55.61 
 
 		 385 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  55.35 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  53.8 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  55.38 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  55.15 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  54.59 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  55.15 
 
 		 384 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  55.15 
 
 		 384 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  55.38 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  54.88 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  54.62 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  55.91 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  48.3 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  54.59 
 
 		 384 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.4 
 
 		 382 aa  245  9e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  37.36 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  33.08 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  37.46 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  36.25 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  33.76 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  29.77 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 		 379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  27.38 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.86 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.72 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  23.27 
 
 		 854 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 		 848 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  23.81 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  26.14 
 
 		 419 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.76 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  28.37 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.79 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  33.53 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  28.3 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  24.23 
 
 		 868 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  30.41 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  32.94 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.77 
 
 		 857 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.73 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  28.79 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  26.05 
 
 		 787 aa  50.4  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  26.8 
 
 		 793 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1006  hypothetical protein  26.59 
 
 		 401 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.94 
 
 		 397 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  25.26 
 
 		 828 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 859 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  38.1 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  34.82 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.49 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1759  hypothetical protein  36.11 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.65 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  30.05 
 
 		 825 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.57 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.65 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.71 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  28.97 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  28.89 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  23.66 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  20.53 
 
 		 947 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.21 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.17 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 		 838 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.01 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 		 789 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 		 789 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  25.22 
 
 		 788 aa  46.2  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.2 
 
 		 415 aa  46.2  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.83 
 
 		 642 aa  46.2  0.0009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  24.54 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  25.52 
 
 		 787 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.52 
 
 		 836 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.6 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.7 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  41.18 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  24.81 
 
 		 793 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  28.8 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  21.74 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  22.04 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.53 
 
 		 415 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6689  hypothetical protein  34.38 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874754  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  28.32 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1468  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.39 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.32 
 
 		 649 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.39 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.77 
 
 		 649 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  36.89 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>