More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1443 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 440 aa  911    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 427 aa  118  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 516 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 323 aa  97.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.27 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  37.14 
 
 		 354 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 323 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.66 
 
 		 365 aa  87  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 501 aa  86.3  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  26.02 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.25 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.78 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.11 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  24 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.39 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 800 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 1002 aa  76.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 414 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  23.31 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  25.63 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  31.65 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.54 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.23 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  23.56 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  24.24 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.2 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.4 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  32.88 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.57 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  33.79 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.45 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  35.43 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  23.25 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>