More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3381 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3381  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1174    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2395  surface antigen (D15)  38.53 
 
 		 610 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0245  surface antigen (D15)  41.54 
 
 		 598 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1182  putative outer membrane protein  39.45 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2844  surface antigen (D15)  39.27 
 
 		 607 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2621  surface antigen (D15)  38.33 
 
 		 627 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.22139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2679  surface antigen (D15)  36.6 
 
 		 627 aa  349  8e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1521  surface antigen (D15)  36.35 
 
 		 643 aa  323  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0423746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0048  hypothetical protein  35.89 
 
 		 639 aa  320  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0047  hypothetical protein  35.71 
 
 		 639 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.858357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0053  surface antigen (D15)  35.82 
 
 		 671 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1344  OMP85 family outer membrane protein  29.51 
 
 		 653 aa  273  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3914  surface antigen (D15)  29.74 
 
 		 622 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0932494  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3626  surface antigen (D15)  29.69 
 
 		 622 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  32.12 
 
 		 637 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  31.41 
 
 		 653 aa  211  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2765  surface antigen (D15)  29.83 
 
 		 661 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2992  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 661 aa  207  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26833  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4088  hypothetical protein  29.88 
 
 		 620 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1716  surface antigen (D15)  30.71 
 
 		 653 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2888  surface antigen (D15)  29.26 
 
 		 661 aa  203  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  28.47 
 
 		 665 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  30.13 
 
 		 663 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2389  surface antigen (D15)  28.19 
 
 		 652 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253042 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1129  surface antigen (D15)  31.65 
 
 		 776 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  26.22 
 
 		 677 aa  184  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0414  surface antigen (D15)  26.33 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.184452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2099  surface antigen  28.62 
 
 		 632 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0433  surface antigen (D15)  28.55 
 
 		 595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.933362 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0465  surface antigen (D15)  24.96 
 
 		 702 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.9475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  25.81 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0384  surface antigen (D15)  29.93 
 
 		 615 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2483  surface antigen (D15)  27.62 
 
 		 593 aa  150  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.190586  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2905  surface antigen (D15)  26.33 
 
 		 789 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0651948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0165  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 647 aa  140  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0071  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like  25.65 
 
 		 613 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.299818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  25.38 
 
 		 610 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0071  surface antigen (D15)  24.05 
 
 		 633 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.309783  normal  0.034078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2644  surface antigen (D15)  26.16 
 
 		 571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1102  surface antigen (D15)  25.62 
 
 		 709 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3625  OMP85 family outer membrane protein  25.04 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3770  surface antigen (D15)  25.04 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2199  surface antigen (D15)  23.86 
 
 		 595 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.230672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3962  OMP85 family outer membrane protein  25 
 
 		 578 aa  102  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1797  surface antigen (D15)  23.76 
 
 		 618 aa  97.1  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0788  surface antigen (D15)  24.95 
 
 		 594 aa  97.1  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4827  surface antigen (D15)  24.27 
 
 		 670 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  23.21 
 
 		 578 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2193  surface antigen (D15)  24.16 
 
 		 595 aa  94  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2395  surface antigen (D15)  23.6 
 
 		 583 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.920675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0833  hypothetical protein  25.89 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0128736  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0822  surface antigen (D15)  25 
 
 		 591 aa  93.2  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2597  surface antigen (D15)  23.97 
 
 		 595 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.837679  normal  0.491309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.69 
 
 		 657 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2890  surface antigen (D15)  22.28 
 
 		 580 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.140509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0855  surface antigen (D15)  23.33 
 
 		 605 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2798  surface antigen (D15)  22.9 
 
 		 583 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  25.56 
 
 		 835 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3161  surface antigen (D15)  23.85 
 
 		 646 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.288715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2892  surface antigen (D15)  22.36 
 
 		 583 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.939867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0533  surface antigen (D15)  24.4 
 
 		 558 aa  87.4  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 677 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1562  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 779 aa  87  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.386994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0462  surface antigen (D15)  24.8 
 
 		 559 aa  87  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  26.88 
 
 		 677 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0433  surface antigen protein  23.47 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0183436  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4678  outer membrane protein, OMP85 family  23.04 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4774  outer membrane protein OMP85 family  23.04 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4829  OMP85 family outer membrane protein  23.04 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4808  OMP85 family outer membrane protein  23.04 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2749  hypothetical protein  23.5 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129008  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3266  surface antigen (D15)  23.95 
 
 		 609 aa  83.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.09 
 
 		 769 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1820  surface antigen (D15)  23 
 
 		 601 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2478  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.84 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171306  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4689  outer membrane protein, OMP85 family  23.43 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5770  surface antigen (D15)  23.59 
 
 		 604 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0851  OMP85 family outer membrane protein  22.88 
 
 		 682 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.47 
 
 		 749 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0173  surface antigen (D15)  24.85 
 
 		 673 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182212  normal  0.412559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3416  surface antigen (D15)  21.82 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  24.6 
 
 		 765 aa  80.5  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3647  surface antigen (D15)  23.08 
 
 		 575 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.452626  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0398  surface antigen (D15)  22.25 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  21.85 
 
 		 588 aa  80.1  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3575  surface antigen (D15)  21.71 
 
 		 571 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1969  surface antigen (D15)  22.53 
 
 		 573 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2354  surface antigen (D15)  22.48 
 
 		 611 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737137  normal  0.199571 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  23.5 
 
 		 781 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.5 
 
 		 803 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.05 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  23.15 
 
 		 577 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3787  surface antigen (D15)  23.15 
 
 		 577 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.718556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  23.15 
 
 		 577 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  23.15 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  22.74 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  23.15 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  22.74 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  22.74 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  22.74 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>